More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0060 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  100 
 
 		 421 aa  851    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  45.28 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12801  hypothetical protein  36.07 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.103012 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04541  hypothetical protein  34.81 
 
 		 299 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  57.14 
 
 		 5839 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  43.96 
 
 		 1883 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  53.01 
 
 		 1145 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  47.87 
 
 		 813 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.81 
 
 		 588 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.62 
 
 		 4106 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  52.63 
 
 		 1699 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  51.52 
 
 		 1526 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  46.58 
 
 		 2537 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  52.5 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  46.74 
 
 		 744 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  51.32 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  52.5 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  47.67 
 
 		 1538 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  44.55 
 
 		 928 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  48.89 
 
 		 942 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  37.19 
 
 		 3608 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  45.05 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  36.62 
 
 		 219 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.32 
 
 		 2954 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  29.63 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  31.69 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  32.68 
 
 		 1043 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  43.27 
 
 		 867 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  47.87 
 
 		 709 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  39.34 
 
 		 1421 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  57.14 
 
 		 2542 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  28.88 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  46.74 
 
 		 946 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.11 
 
 		 1279 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  44.94 
 
 		 2336 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  41 
 
 		 4798 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  31.42 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  37.38 
 
 		 1814 aa  70.5  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.43 
 
 		 2105 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  45.98 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  39.84 
 
 		 824 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.05 
 
 		 1164 aa  70.5  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 		 3427 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  42.35 
 
 		 2329 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  59.68 
 
 		 6753 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.78 
 
 		 1016 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.86 
 
 		 1795 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  58.06 
 
 		 8682 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  40.74 
 
 		 1499 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.97 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.52 
 
 		 833 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  45.35 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  48.1 
 
 		 2885 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  47.3 
 
 		 1166 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  58.06 
 
 		 9030 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.04 
 
 		 2678 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  55.56 
 
 		 4678 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  45.26 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  43.56 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  46.05 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  46.34 
 
 		 7284 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  42.17 
 
 		 3598 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  34.1 
 
 		 2145 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  50.67 
 
 		 1855 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  40.68 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1424 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  51.43 
 
 		 2667 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.43 
 
 		 1236 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  43.14 
 
 		 2704 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.29 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  30.63 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  49.37 
 
 		 1895 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.13 
 
 		 3314 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  43.01 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  42.39 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  38.46 
 
 		 959 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.75 
 
 		 1372 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  49.25 
 
 		 2775 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.1 
 
 		 2346 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  44.3 
 
 		 589 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  46.91 
 
 		 767 aa  67  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  46 
 
 		 1175 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  43.01 
 
 		 3619 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.84 
 
 		 868 aa  66.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  42.35 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  44 
 
 		 1156 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  30.83 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  56.45 
 
 		 5218 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  27.97 
 
 		 504 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  40.86 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  45.12 
 
 		 3619 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.37 
 
 		 1963 aa  66.6  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  39.6 
 
 		 4854 aa  66.2  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  37.61 
 
 		 510 aa  66.2  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  30.09 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  46.58 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.31 
 
 		 980 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  49.37 
 
 		 950 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 686 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  47.76 
 
 		 1712 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>