202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0043 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0043  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 
239 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0598  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
223 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191676  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  26.57 
 
 
296 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
213 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
219 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3368  2-polyprenylmethoxybenozoquinol methylase  34.17 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  32.57 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.91 
 
 
283 aa  55.8  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  26.39 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  32.48 
 
 
783 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  33.07 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  25.95 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  38.83 
 
 
228 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
217 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  34.68 
 
 
168 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  36.94 
 
 
335 aa  52  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
317 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
288 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  39.09 
 
 
295 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  27.98 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  37.27 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  30.43 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.51 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
392 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  27.54 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.68 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.37 
 
 
255 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  38.46 
 
 
276 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  28.82 
 
 
279 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 
217 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  34.82 
 
 
271 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1854  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  27.19 
 
 
363 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  31.15 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  25.34 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  25.15 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  28.88 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
273 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
281 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.4 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
365 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  36.94 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.81 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  25.73 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 
392 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.48 
 
 
282 aa  45.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  31.82 
 
 
221 aa  46.2  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.75 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
286 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  25.19 
 
 
390 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.51 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
242 aa  45.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.66 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1366  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
235 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0509799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
287 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  32.08 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.68 
 
 
269 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
417 aa  45.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  26.22 
 
 
306 aa  45.8  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
278 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
201 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.39 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.57 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
201 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  25.45 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  25.45 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  29.89 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  35.9 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0894  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000138444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3698  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
323 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.95 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>