19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0036 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0036  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  318  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0041  hypothetical protein  86.62 
 
 
176 aa  229  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00321  hypothetical protein  71.7 
 
 
170 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0537644  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00321  hypothetical protein  72.44 
 
 
170 aa  214  4e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0033  hypothetical protein  70.44 
 
 
170 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00321  hypothetical protein  66.46 
 
 
170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14811  hypothetical protein  64.24 
 
 
173 aa  200  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.686917  normal  0.0260683 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00391  hypothetical protein  82.78 
 
 
171 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1062  hypothetical protein  63.03 
 
 
170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.836162  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19371  hypothetical protein  62.42 
 
 
170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12401  hypothetical protein  59.87 
 
 
172 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2569  hypothetical protein  32.48 
 
 
342 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.110832  hitchhiker  0.000000135786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2363  Putative ammonia monooxygenase-like protein  27.4 
 
 
383 aa  51.2  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  28.29 
 
 
338 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0784  membrane protein AbrB duplication  32.87 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2080  membrane protein AbrB duplication  28.57 
 
 
349 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000252209  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  29.81 
 
 
342 aa  45.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1055  membrane protein AbrB duplication  32.24 
 
 
343 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2363  membrane protein AbrB duplication  30.41 
 
 
384 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>