41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0021 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  69.44 
 
 
75 aa  103  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  58.33 
 
 
81 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00181  hypothetical protein  52.17 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.910571  normal  0.0515701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  52.11 
 
 
79 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  52.11 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  38.89 
 
 
76 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  38.89 
 
 
76 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  50.91 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  61.4 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  54.29 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  44.78 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1345  hypothetical protein  44.78 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  56.6 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  51.52 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  50 
 
 
85 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  50 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00171  hypothetical protein  36.23 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  55.56 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  43.64 
 
 
74 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  43.64 
 
 
74 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  42.59 
 
 
796 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  42.86 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  44.44 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  42.59 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  44.44 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  38.18 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  30.56 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  40.3 
 
 
80 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  35.21 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  37.74 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  35.29 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  36.62 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  35.19 
 
 
92 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  35.19 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  29.17 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  39.29 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  38.98 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  35.71 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  35 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  35.71 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>