More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0016 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 168 aa  350  4e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  84.43 
 
 		 167 aa  301  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  68.26 
 
 		 168 aa  246  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  73.38 
 
 		 168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  63.52 
 
 		 164 aa  226  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  61.64 
 
 		 164 aa  222  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  62.89 
 
 		 164 aa  222  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  63.06 
 
 		 164 aa  221  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  68.87 
 
 		 155 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  68.21 
 
 		 155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  61.88 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  59.01 
 
 		 164 aa  194  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  63.7 
 
 		 161 aa  184  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  59.06 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  58.44 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  53.94 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  58.39 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  54.43 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  57.43 
 
 		 165 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  62.22 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  62.22 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  62.22 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  54.32 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  54.09 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  49.7 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  52.91 
 
 		 176 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  53.89 
 
 		 198 aa  173  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  60.58 
 
 		 171 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  50.62 
 
 		 161 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  54.09 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  53.89 
 
 		 171 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  50.6 
 
 		 171 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  54.61 
 
 		 167 aa  170  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  50.9 
 
 		 169 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  64.71 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  51.83 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  63.56 
 
 		 174 aa  167  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  63.56 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  51.53 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  51.5 
 
 		 167 aa  164  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  60.83 
 
 		 190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  61.98 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0879  methionine-R-sulfoxide reductase  59.02 
 
 		 135 aa  161  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.950161  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 137 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  49.69 
 
 		 160 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 138 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 138 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  52.45 
 
 		 164 aa  157  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  61.34 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  59.83 
 
 		 151 aa  157  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  59.35 
 
 		 157 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  52.53 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  58.2 
 
 		 138 aa  151  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 		 229 aa  151  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  58.2 
 
 		 138 aa  151  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  59.66 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  54.55 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  63.81 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  57.63 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  55.74 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  56.3 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  46.06 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 180 aa  140  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  46.91 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  56.56 
 
 		 131 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  54.24 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  51.18 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  55.93 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  54.76 
 
 		 133 aa  138  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  55.46 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 		 133 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  53.72 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  52.07 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  53.38 
 
 		 136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  52.94 
 
 		 136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  53.28 
 
 		 133 aa  134  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  47.79 
 
 		 137 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 		 148 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  53.72 
 
 		 148 aa  134  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  49.58 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  53.6 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 		 136 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  50.83 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  51.24 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  53.08 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 137 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  50.4 
 
 		 131 aa  131  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  47.58 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  52.14 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>