More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2677 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 124 aa  253  6e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  89.74 
 
 		 126 aa  218  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  83.47 
 
 		 124 aa  212  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  74.79 
 
 		 172 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  68.55 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  67.74 
 
 		 138 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  68 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  66.38 
 
 		 152 aa  169  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  69.37 
 
 		 174 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  71.03 
 
 		 153 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  64 
 
 		 107 aa  133  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  59.34 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  61.29 
 
 		 117 aa  115  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  53.33 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  50.48 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 106 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  53.93 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  49.52 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  39.6 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  39.6 
 
 		 134 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  34.19 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  37.38 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  41.11 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  34.41 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  35.35 
 
 		 210 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  31.37 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  31 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  38.82 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  25.84 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  30.69 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  35.16 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  32.32 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  33.33 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  27.56 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0636  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000427739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  39.29 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>