More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2606 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  80 
 
 		 575 aa  940    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 575 aa  1159    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  54.29 
 
 		 578 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  50.44 
 
 		 586 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  49.48 
 
 		 589 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 586 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  50.35 
 
 		 586 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  48.34 
 
 		 583 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  47.47 
 
 		 583 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  39.73 
 
 		 585 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  38.65 
 
 		 578 aa  392  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  38.65 
 
 		 578 aa  392  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  38.65 
 
 		 578 aa  392  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  39.5 
 
 		 577 aa  382  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  34.03 
 
 		 591 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  39.23 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  35.99 
 
 		 596 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  34.19 
 
 		 581 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  38.98 
 
 		 556 aa  355  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  35.36 
 
 		 586 aa  351  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  39.67 
 
 		 555 aa  350  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  34.89 
 
 		 589 aa  350  4e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  36.67 
 
 		 544 aa  349  9e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  37.24 
 
 		 568 aa  346  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  33.65 
 
 		 584 aa  343  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  37.57 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  34.91 
 
 		 559 aa  333  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  34.72 
 
 		 559 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  34.72 
 
 		 559 aa  333  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  34.72 
 
 		 559 aa  333  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  34.72 
 
 		 559 aa  332  8e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  34.47 
 
 		 559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  33.22 
 
 		 565 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 561 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  27.88 
 
 		 494 aa  178  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  27.78 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  27.39 
 
 		 494 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  27 
 
 		 508 aa  173  5.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  29.71 
 
 		 493 aa  173  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  26.1 
 
 		 492 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  25.99 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  25.99 
 
 		 492 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  25.99 
 
 		 492 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  30.48 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  26.71 
 
 		 493 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  25.42 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  24.05 
 
 		 483 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  24.75 
 
 		 492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  24.65 
 
 		 485 aa  153  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  29.96 
 
 		 638 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 644 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  25.39 
 
 		 498 aa  140  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  28.92 
 
 		 650 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  27.34 
 
 		 636 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  29.63 
 
 		 643 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  26.51 
 
 		 652 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  21.39 
 
 		 534 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  27.15 
 
 		 638 aa  131  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  25.75 
 
 		 482 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  25.66 
 
 		 646 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  24.83 
 
 		 645 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  27.76 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  28.66 
 
 		 641 aa  128  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  24.74 
 
 		 651 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  25.3 
 
 		 649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  27.24 
 
 		 650 aa  122  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  32.33 
 
 		 558 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  29.17 
 
 		 672 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  27.12 
 
 		 645 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  26.41 
 
 		 657 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  25.06 
 
 		 572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  24.82 
 
 		 572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  24.78 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  27.56 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  25.06 
 
 		 553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  27.59 
 
 		 650 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  25.75 
 
 		 548 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  26.25 
 
 		 639 aa  110  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  27.76 
 
 		 591 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  26.88 
 
 		 667 aa  110  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  26.46 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  27.88 
 
 		 598 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  24.05 
 
 		 553 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  26.91 
 
 		 642 aa  108  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  21.88 
 
 		 1098 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  22.94 
 
 		 651 aa  107  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  27.11 
 
 		 562 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  29 
 
 		 598 aa  107  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  27.62 
 
 		 610 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  24.28 
 
 		 1095 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  27.81 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  25.28 
 
 		 1092 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  23.96 
 
 		 1110 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  26.46 
 
 		 1088 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  22.5 
 
 		 1102 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  26.71 
 
 		 551 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  22.5 
 
 		 1102 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  24.3 
 
 		 661 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  28.57 
 
 		 1085 aa  104  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  26.28 
 
 		 574 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>