61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2529 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  85.35 
 
 		 460 aa  669    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  100 
 
 		 431 aa  850    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  72.33 
 
 		 435 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  68.4 
 
 		 437 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  68.16 
 
 		 437 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  66.43 
 
 		 434 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  65.26 
 
 		 436 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  67.84 
 
 		 434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  68.08 
 
 		 434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  38.66 
 
 		 421 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  39.71 
 
 		 428 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  37.53 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  39.47 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  39.01 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  37.56 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  38.72 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  38.72 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  38.72 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  38.72 
 
 		 424 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  38.48 
 
 		 424 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  34.91 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  38.32 
 
 		 421 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  34.43 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  37.53 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  36.43 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  36.26 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  32.63 
 
 		 421 aa  226  8e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  38.8 
 
 		 452 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  37.29 
 
 		 396 aa  223  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  38.28 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  37.18 
 
 		 422 aa  216  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  34.7 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  33.96 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  32.95 
 
 		 420 aa  209  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  34.29 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  36.23 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  32.81 
 
 		 418 aa  192  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  33.42 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  33.96 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.08 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  22.81 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  23.75 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  25.43 
 
 		 468 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  23.36 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  25.74 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  25.78 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.05 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  24.39 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  24.68 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.32 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  28.2 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  28.2 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  25.32 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05633  transporter protein smf2 (AFU_orthologue; AFUA_4G10990)  31.25 
 
 		 597 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.872835 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  27.82 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  29.55 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  25.65 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  26.06 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  24.63 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  28.46 
 
 		 439 aa  43.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>