55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2528 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  68.16 
 
 
267 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  44.34 
 
 
259 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  39.19 
 
 
246 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.74 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  32.55 
 
 
248 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  32.86 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.86 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  30.6 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  32.41 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.9 
 
 
248 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  33.03 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  30.8 
 
 
250 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0634  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.84 
 
 
237 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137555  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0116  hypothetical protein  28.89 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  92  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000295507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  29.36 
 
 
237 aa  92  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14301  hypothetical protein  31.54 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3559  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.83 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3276  hypothetical protein  35.42 
 
 
102 aa  82.4  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582387 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01301  hypothetical protein  23.31 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.627797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1454  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.4 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.88 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  26.82 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  26.82 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  24.23 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000261911  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0268  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.81 
 
 
631 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4385  hypothetical protein  30.52 
 
 
252 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.016831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2682  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.7 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3421  hypothetical protein  23.7 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1690  SurA domain protein  25.52 
 
 
311 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0553768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4524  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  35.29 
 
 
433 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0864  SurA domain-containing protein  28.1 
 
 
434 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000162907  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 
434 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  28.57 
 
 
434 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.57 
 
 
434 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3511  hypothetical protein  24.71 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1048  SurA domain-containing protein  27.73 
 
 
434 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000188646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1081  SurA domain-containing protein  27.73 
 
 
434 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00545123  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3311  SurA domain protein  27.73 
 
 
434 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000542375  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0979  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.73 
 
 
434 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.92 
 
 
434 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000138448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4381  hypothetical protein  22.79 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  31.93 
 
 
441 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3480  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.3 
 
 
326 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.14 
 
 
447 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1053  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.33 
 
 
416 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0556078  normal  0.850667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3077  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.86 
 
 
434 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.69 
 
 
434 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000301767  normal  0.688163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0957  peptidylprolyl isomerase  25.15 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  31.09 
 
 
439 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1016  SurA domain-containing protein  26.15 
 
 
434 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000539949  hitchhiker  0.00270369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  31.09 
 
 
441 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  31.09 
 
 
439 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.89 
 
 
434 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>