More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2380 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  71.15 
 
 		 209 aa  304  8.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  67.31 
 
 		 216 aa  281  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  54.93 
 
 		 215 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  49.28 
 
 		 212 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  48.8 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  49.02 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  53.88 
 
 		 211 aa  225  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  53.88 
 
 		 211 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  55.87 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  47.17 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  51.3 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.5 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.18 
 
 		 209 aa  164  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  44.64 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  44.55 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  42.02 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  40 
 
 		 199 aa  157  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  45.33 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  46.74 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  48.37 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  51.98 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  41.44 
 
 		 203 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  42.93 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  49.72 
 
 		 688 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.28 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 901 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  47.51 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  44.86 
 
 		 213 aa  151  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  42.18 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  43.98 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.08 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  44.81 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  43.41 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  53.11 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  41.51 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 686 aa  148  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.19 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  41.67 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  45.25 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  51.48 
 
 		 686 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.94 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.24 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.02 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  39.25 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 206 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  46.19 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 707 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  44.67 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  46 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 705 aa  141  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  38.43 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.65 
 
 		 703 aa  141  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  37.56 
 
 		 197 aa  141  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  38.94 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  37.22 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  44.69 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  42.53 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  44.94 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  41.51 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.64 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.38 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  44.71 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.09 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  46 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  49.16 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>