More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2365 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  100 
 
 
322 aa  644    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0325  cysteine synthase K/M/A  84.47 
 
 
322 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26311  O-acetylserine (thiol)-lyase A  77.64 
 
 
328 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  70.19 
 
 
322 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1490  cysteine synthase  69.25 
 
 
322 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01951  O-acetylserine (thiol)-lyase A  69.72 
 
 
322 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.958038  normal  0.621094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  63.81 
 
 
320 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  65.91 
 
 
320 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  66.56 
 
 
320 aa  394  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  66.23 
 
 
319 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  65.61 
 
 
320 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  65.58 
 
 
313 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01371  O-acetylserine (thiol)-lyase A  62.73 
 
 
322 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.225049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  67.21 
 
 
320 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  64.29 
 
 
330 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  65.58 
 
 
321 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01401  O-acetylserine (thiol)-lyase A  62.42 
 
 
322 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.171257  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01411  O-acetylserine (thiol)-lyase A  62.11 
 
 
322 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0126  cysteine synthase  61.8 
 
 
322 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.809486  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  65.91 
 
 
320 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  63.43 
 
 
320 aa  371  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  65.91 
 
 
320 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  67.86 
 
 
334 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  60 
 
 
311 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  61.34 
 
 
311 aa  362  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  64.08 
 
 
310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  63.52 
 
 
309 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  63.52 
 
 
309 aa  347  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  60.84 
 
 
308 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  63.58 
 
 
327 aa  345  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  62.78 
 
 
309 aa  346  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  60.07 
 
 
322 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  59.55 
 
 
308 aa  345  8e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  57 
 
 
312 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  62.42 
 
 
309 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  60.13 
 
 
329 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  59.42 
 
 
308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  62.38 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  60.73 
 
 
322 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  61.17 
 
 
310 aa  342  7e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  60.06 
 
 
323 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  61.04 
 
 
309 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  56.63 
 
 
311 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  56.17 
 
 
312 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  61.04 
 
 
309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  60.26 
 
 
339 aa  338  8e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  62.46 
 
 
311 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  61.26 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  60.39 
 
 
309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  58.33 
 
 
309 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  57.65 
 
 
327 aa  335  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  62.01 
 
 
314 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  59.35 
 
 
309 aa  334  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  58.63 
 
 
311 aa  333  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  59.93 
 
 
327 aa  333  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  56.63 
 
 
310 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0556  cysteine synthases  59.48 
 
 
323 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  60.13 
 
 
308 aa  332  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  56.49 
 
 
304 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  59.48 
 
 
331 aa  330  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  57.01 
 
 
317 aa  330  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  54.63 
 
 
311 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  59.87 
 
 
310 aa  330  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  58.31 
 
 
308 aa  329  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  59.09 
 
 
308 aa  328  6e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  56.49 
 
 
310 aa  328  9e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  60.26 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  59.29 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  60.26 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  58.2 
 
 
311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  57.52 
 
 
316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  58.58 
 
 
309 aa  326  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  57.88 
 
 
311 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  57.69 
 
 
311 aa  325  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  56.31 
 
 
309 aa  325  7e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  57.84 
 
 
320 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  59.74 
 
 
309 aa  325  9e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  59.09 
 
 
309 aa  324  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  59.16 
 
 
311 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  56.54 
 
 
317 aa  324  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  57.74 
 
 
308 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  56.68 
 
 
311 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  58.44 
 
 
309 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  55.45 
 
 
309 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  56.44 
 
 
320 aa  322  4e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  56.86 
 
 
320 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  59.6 
 
 
325 aa  322  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  55.99 
 
 
309 aa  323  4e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  57.79 
 
 
310 aa  322  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.25 
 
 
310 aa  322  8e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.25 
 
 
310 aa  322  8e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  55.63 
 
 
317 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  58.12 
 
 
309 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  54.75 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  59.03 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  58.63 
 
 
311 aa  319  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  58.25 
 
 
310 aa  319  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  58.82 
 
 
328 aa  319  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  56.11 
 
 
320 aa  318  5e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  54.4 
 
 
311 aa  319  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>