59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2331 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  67.96 
 
 
449 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  81.72 
 
 
465 aa  774    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 
465 aa  930    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  65.22 
 
 
464 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  76.47 
 
 
465 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  67.73 
 
 
449 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  63.3 
 
 
451 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  60.59 
 
 
453 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  60.18 
 
 
453 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  52.97 
 
 
470 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  60.93 
 
 
448 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  58.89 
 
 
441 aa  531  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  59.08 
 
 
446 aa  531  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  61.15 
 
 
452 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  51.2 
 
 
459 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  51.2 
 
 
470 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  50.98 
 
 
459 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  58.09 
 
 
456 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  45.33 
 
 
440 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  43.75 
 
 
439 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  44.67 
 
 
443 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  42.19 
 
 
487 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  40.09 
 
 
445 aa  346  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  41.1 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  43.45 
 
 
451 aa  339  7e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  39.04 
 
 
454 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  44.88 
 
 
433 aa  333  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  43.06 
 
 
430 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  39.16 
 
 
450 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  41.2 
 
 
433 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  38.39 
 
 
438 aa  320  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  43.47 
 
 
436 aa  315  8e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  43.26 
 
 
432 aa  315  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  38.07 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  43.06 
 
 
432 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  37.81 
 
 
501 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  37.4 
 
 
515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  42.62 
 
 
442 aa  310  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  36.46 
 
 
508 aa  307  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  39.36 
 
 
442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  40.91 
 
 
444 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  36.85 
 
 
433 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  35.31 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  35.31 
 
 
445 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  38.31 
 
 
496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  35.33 
 
 
523 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  34.59 
 
 
460 aa  236  6e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  38.03 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  33.48 
 
 
477 aa  217  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  33.18 
 
 
457 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  33.86 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  33.75 
 
 
436 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  33.75 
 
 
436 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2422  hypothetical protein  30.86 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1116  methanogenesis marker protein 10  32.5 
 
 
436 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0867  hypothetical protein  31.25 
 
 
436 aa  47.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  31.25 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0508  hypothetical protein  35.94 
 
 
413 aa  43.9  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0774462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.06 
 
 
374 aa  43.9  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>