More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2293 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1311    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  51.97 
 
 		 704 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  51.12 
 
 		 1676 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 780 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 661 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  34.07 
 
 		 779 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  33.71 
 
 		 653 aa  324  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 779 aa  324  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.54 
 
 		 865 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1364  SAM-binding motif-containing protein  33.92 
 
 		 580 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.460424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.02 
 
 		 875 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.57 
 
 		 414 aa  128  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  44.72 
 
 		 594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  30.11 
 
 		 399 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  29.32 
 
 		 395 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1065  methyltransferase type 12  31.02 
 
 		 360 aa  104  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3000  Methyltransferase type 12  32.41 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  43.22 
 
 		 837 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  32.87 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  33.18 
 
 		 399 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  43.48 
 
 		 936 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12103  hypothetical protein  29.58 
 
 		 407 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00110715  normal  0.946541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 400 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  27.31 
 
 		 407 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.83 
 
 		 402 aa  95.1  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  27.24 
 
 		 403 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3879  Methyltransferase type 12  30.32 
 
 		 359 aa  91.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3967  Methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 359 aa  89.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000336938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  30.16 
 
 		 360 aa  89  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  28.72 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0372  methyltransferase type 12  34.27 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 583 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  27.41 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  30.06 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  32.8 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  23.59 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  37.14 
 
 		 514 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4260  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 267 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 732 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  29.91 
 
 		 425 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 833 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 828 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.46 
 
 		 816 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 612 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.36 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 2262 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 670 aa  67.8  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  32.79 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 828 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 833 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 750 aa  67  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 543 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 440 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 323 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 681 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  25.45 
 
 		 398 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 754 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 754 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 878 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 2262 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  32.31 
 
 		 725 aa  64.7  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  35.14 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 3145 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.71 
 
 		 252 aa  63.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  23.97 
 
 		 441 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  23.97 
 
 		 441 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30.93 
 
 		 550 aa  63.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1406 aa  62  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 635 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 635 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 637 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  32.31 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2600  TPR repeat-containing protein  19.82 
 
 		 667 aa  61.6  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.11 
 
 		 810 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 909 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 847 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 612 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 605 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.01 
 
 		 447 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.13 
 
 		 237 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>