193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2277 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2277  large-conductive mechanosensitive channel  100 
 
 		 109 aa  219  7e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.589434  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  29.13 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2555  large conductance mechanosensitive channel protein  37.89 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1991  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.595696  normal  0.288973 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  31.37 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  34.41 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3243  large conductance mechanosensitive channel protein  30.39 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0695939 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  30.21 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  31.71 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  27.12 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1428  large conductance mechanosensitive channel protein  36.17 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000461871  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  26.27 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  33.04 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  30.95 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  31.46 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  28.12 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  25.89 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  31.07 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  28.97 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0941  large conductance mechanosensitive channel protein  33.03 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.954406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  26.5 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  33.7 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  30.89 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  24.55 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  31.43 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  27.59 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  30.16 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  30.16 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  26.32 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  33.67 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  26.73 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3491  large conductance mechanosensitive channel protein  31.13 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.215655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  29.13 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  26.32 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  26.61 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  29.13 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  25.49 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  29.13 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  29.13 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  32.04 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  26.36 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4749  large conductance mechanosensitive channel protein  30 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  33.02 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  32.04 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  28.45 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  27.93 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  32.04 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  39.33 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  39.33 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  28.45 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  26.92 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  30.1 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  29.13 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  27.73 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  27.66 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  29.81 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  28.18 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  29.9 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  23.58 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  29.63 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  31.25 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  28.18 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0035  large conductance mechanosensitive channel protein  29.81 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262039  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  30.91 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  30.1 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  31.37 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  29.82 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  24.37 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  27.12 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0374  large-conductance mechanosensitive channel  27.83 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.606039  normal  0.0231483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0381  large-conductance mechanosensitive channel  26.27 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000132352  hitchhiker  0.000000656046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  31.53 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  31.53 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  28.04 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  29.13 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  22.94 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  26.79 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  31.07 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  30.1 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  30.25 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  27.68 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  29.03 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  27.97 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  26.36 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf609  large-conductance mechanosensitive channel, putative  37.33 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.141906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0992  large-conductance mechanosensitive channel  28.46 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  26.47 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  27.1 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  27.1 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  28.16 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  27.1 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  28.44 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  29.13 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  28.28 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>