146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2276 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  100 
 
 
524 aa  1065    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  31.76 
 
 
500 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  29.88 
 
 
495 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  31.51 
 
 
527 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  32.03 
 
 
521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  30.42 
 
 
507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  30.46 
 
 
525 aa  164  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  29.38 
 
 
525 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  30.67 
 
 
542 aa  158  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  32.29 
 
 
506 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  29.2 
 
 
499 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  28.39 
 
 
522 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  26.98 
 
 
521 aa  153  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  28.33 
 
 
511 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  28.33 
 
 
511 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  28.33 
 
 
511 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  29.49 
 
 
522 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  31.49 
 
 
485 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  29.51 
 
 
520 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  27.48 
 
 
532 aa  151  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  29.52 
 
 
542 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  29.8 
 
 
557 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  29.2 
 
 
508 aa  149  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  26.79 
 
 
524 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  29.22 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  29.03 
 
 
520 aa  148  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  29.72 
 
 
540 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  27.9 
 
 
523 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  31.6 
 
 
535 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  30.91 
 
 
495 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  29.6 
 
 
521 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  30.43 
 
 
516 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  30.49 
 
 
508 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  30.49 
 
 
508 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  29.57 
 
 
515 aa  143  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  30.49 
 
 
533 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  28.78 
 
 
537 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  29.89 
 
 
547 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  28.74 
 
 
515 aa  140  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  38.15 
 
 
564 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  29.57 
 
 
571 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  30.34 
 
 
518 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  29.29 
 
 
538 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  28.49 
 
 
542 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  26.2 
 
 
476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  27.64 
 
 
539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  34.19 
 
 
597 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  27.12 
 
 
504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  29.18 
 
 
556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  38.6 
 
 
551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  27.03 
 
 
643 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  27.71 
 
 
505 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  27.17 
 
 
545 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  29.77 
 
 
521 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  26.46 
 
 
486 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  37.09 
 
 
535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  27.56 
 
 
504 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  31.4 
 
 
551 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  27.52 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  29 
 
 
530 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  24.45 
 
 
506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  28.92 
 
 
546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  28.39 
 
 
515 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  32.92 
 
 
505 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  26.46 
 
 
541 aa  116  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  25.59 
 
 
546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  30.06 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  34.72 
 
 
544 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  32.88 
 
 
597 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  25.3 
 
 
504 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  26.17 
 
 
499 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  33.85 
 
 
527 aa  110  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  33.33 
 
 
522 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  29.13 
 
 
505 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  26.86 
 
 
508 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.38 
 
 
494 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  34.15 
 
 
300 aa  107  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  25.41 
 
 
508 aa  106  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  31.18 
 
 
459 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  32.38 
 
 
518 aa  106  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  33.33 
 
 
750 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  25.83 
 
 
532 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  27.15 
 
 
536 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  27.18 
 
 
484 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
486 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 
525 aa  93.6  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  23.14 
 
 
480 aa  90.5  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  23.87 
 
 
540 aa  90.1  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  23.64 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  24.24 
 
 
519 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  25.32 
 
 
555 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  23.88 
 
 
545 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  26.3 
 
 
623 aa  86.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  31.92 
 
 
542 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  25.57 
 
 
559 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  26.97 
 
 
557 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  23.75 
 
 
549 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  25.31 
 
 
517 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  24.02 
 
 
613 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>