39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2260 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2260  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  206  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.48974  normal  0.571273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0420  hypothetical protein  82.73 
 
 
110 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03211  hypothetical protein  71.56 
 
 
119 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01251  hypothetical protein  61.22 
 
 
99 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0502319  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1424  hypothetical protein  60.2 
 
 
99 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  54 
 
 
102 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00731  hypothetical protein  53.85 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0063  hypothetical protein  53.76 
 
 
104 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  57.95 
 
 
97 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  60.23 
 
 
94 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00721  hypothetical protein  50.54 
 
 
101 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  58.33 
 
 
95 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0052  hypothetical protein  56.96 
 
 
97 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  55.95 
 
 
97 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  58.97 
 
 
96 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  58.97 
 
 
96 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3708  protein of unknown function YGGT  50 
 
 
94 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10668  predicted protein  53.16 
 
 
82 aa  87.4  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14996  predicted protein  50.68 
 
 
85 aa  80.1  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00701  hypothetical protein  61.22 
 
 
57 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.353253  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  31.17 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  31.17 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  31.17 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  29.87 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  30.3 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  26.47 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  32.88 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  28.92 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  30.67 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  26.83 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  26.83 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  26.03 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  28.57 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  30 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  29.41 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  29.55 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  33.93 
 
 
84 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
196 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>