29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2232 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2232  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  320  5e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0293089  decreased coverage  0.00918627 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0443  hypothetical protein  58.87 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.128989  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1641  hypothetical protein  48.15 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1668  hypothetical protein  48.15 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.356624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0426  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0670277  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1669  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1284  hypothetical protein  31.91 
 
 		 257 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3215  hypothetical protein  31.17 
 
 		 288 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4427  hypothetical protein  28.29 
 
 		 283 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.39537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2874  hypothetical protein  27.74 
 
 		 257 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4254  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  0.787594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2989  hypothetical protein  30.5 
 
 		 257 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3253  hypothetical protein  31.21 
 
 		 283 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2719  hypothetical protein  28.29 
 
 		 257 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0944  hypothetical protein  28.37 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1181  hypothetical protein  28.77 
 
 		 259 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.784089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0569  hypothetical protein  40.62 
 
 		 252 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3034  hypothetical protein  27.87 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3876  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.03 
 
 		 257 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0563  hypothetical protein  28.99 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2180  hypothetical protein  29.79 
 
 		 264 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0842279  normal  0.0191302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3952  hypothetical protein  29.51 
 
 		 294 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4320  hypothetical protein  29.51 
 
 		 281 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0350  hypothetical protein  25.66 
 
 		 244 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3177  hypothetical protein  29.63 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2735  hypothetical protein  27.12 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003590  hypothetical protein  43.33 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0325  hypothetical protein  29.41 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0198  hypothetical protein  26.32 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>