276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2224 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  448  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  56.89 
 
 
227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  56.89 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  49.56 
 
 
222 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  50.91 
 
 
222 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  47.14 
 
 
221 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  48.23 
 
 
219 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  47.35 
 
 
219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  47.35 
 
 
219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  47.56 
 
 
219 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.56 
 
 
227 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  39.35 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.01 
 
 
218 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.32 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  38.83 
 
 
209 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.25 
 
 
219 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.84 
 
 
219 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  39.73 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  33.77 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.06 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
232 aa  95.9  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  28.77 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  32.3 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  27.07 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  29.96 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  32.47 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  30.09 
 
 
231 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  36 
 
 
218 aa  85.1  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  29.77 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  31.79 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.79 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  32.7 
 
 
366 aa  78.6  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  29.36 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  30.08 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  31.16 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  28.39 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  31.28 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.76 
 
 
230 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
231 aa  62.4  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  32.48 
 
 
332 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.68 
 
 
494 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  35.43 
 
 
126 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  26.64 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  31.34 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  26.22 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  27.14 
 
 
297 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
212 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  27.04 
 
 
267 aa  59.3  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.86 
 
 
271 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17427  predicted protein  31.85 
 
 
312 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.65 
 
 
291 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  27.4 
 
 
294 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  26.89 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  29.33 
 
 
293 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  28.74 
 
 
289 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  23.68 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
301 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.97 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  23.68 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.92 
 
 
320 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.12 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  33.53 
 
 
308 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  26.89 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  29.94 
 
 
290 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  26.76 
 
 
257 aa  55.5  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.21 
 
 
328 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  25.76 
 
 
210 aa  55.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.16 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.98 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  29.41 
 
 
372 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>