More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2187 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
316 aa  636    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0489  F0F1 ATP synthase subunit gamma  87.03 
 
 
317 aa  541  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04841  F0F1 ATP synthase subunit gamma  78.48 
 
 
316 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0980  F0F1 ATP synthase subunit gamma  78.8 
 
 
316 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18481  F0F1 ATP synthase subunit gamma  78.8 
 
 
316 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.672263 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15691  F0F1 ATP synthase subunit gamma  75.63 
 
 
316 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.75 
 
 
316 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16521  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.48 
 
 
316 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.38 
 
 
316 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.198196  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16291  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.79 
 
 
316 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.4 
 
 
316 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  65.4 
 
 
315 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  64.44 
 
 
314 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.9 
 
 
315 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  61.9 
 
 
315 aa  403  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.59 
 
 
314 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.59 
 
 
314 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  62.22 
 
 
314 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  51.13 
 
 
369 aa  322  6e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  50.46 
 
 
365 aa  310  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  41.43 
 
 
309 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.68 
 
 
283 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.87 
 
 
287 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.24 
 
 
287 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
281 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.71 
 
 
288 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 
287 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.85 
 
 
287 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 
287 aa  205  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.16 
 
 
288 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.83 
 
 
286 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.17 
 
 
290 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.71 
 
 
286 aa  202  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  36.59 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.03 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  37.3 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  40.2 
 
 
291 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  37.54 
 
 
345 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.74 
 
 
294 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.05 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.05 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.05 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  36.19 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.91 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.91 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.56 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.03 
 
 
286 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
287 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 
288 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  37.85 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.71 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.83 
 
 
295 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
289 aa  196  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
291 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.79 
 
 
294 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.36 
 
 
295 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.76 
 
 
286 aa  195  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
286 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
286 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
286 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
286 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.24 
 
 
293 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  35.13 
 
 
295 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.42 
 
 
287 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  38.44 
 
 
294 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
286 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.44 
 
 
288 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.94 
 
 
288 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  35.31 
 
 
288 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
286 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.31 
 
 
286 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  37.19 
 
 
295 aa  192  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  35 
 
 
286 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  37.78 
 
 
287 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
290 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.65 
 
 
286 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
290 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.56 
 
 
288 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.65 
 
 
293 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 
289 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  35.42 
 
 
287 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  32.93 
 
 
310 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.48 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.87 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4137  ATP synthase F1, gamma subunit  35.26 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  33.54 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.39 
 
 
289 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.48 
 
 
291 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>