More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2185 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
109 aa  223  9e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  79.65 
 
 
113 aa  187  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  54.29 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  53.33 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  56.31 
 
 
105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  50.93 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  56.44 
 
 
105 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  53.47 
 
 
104 aa  120  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  52.88 
 
 
107 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  48.57 
 
 
111 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  49 
 
 
105 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  49 
 
 
105 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  45.63 
 
 
106 aa  106  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  52.63 
 
 
104 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  45.28 
 
 
121 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  52.63 
 
 
104 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  42.99 
 
 
122 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  44.86 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  41.12 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  42.06 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  41.12 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  42.72 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  42.72 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  41.12 
 
 
124 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  40.19 
 
 
124 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  40.19 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  38.32 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  42.55 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  45.68 
 
 
94 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  40.62 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  41.41 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  41.41 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  37.38 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  40.4 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  40.86 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  37.38 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  40.86 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  41.3 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  35.85 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  37.76 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  40.86 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  39.78 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  39.78 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  38.71 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  39.78 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  37.63 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  41.38 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  47.22 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  37.37 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  41.98 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  47.22 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  39.76 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  35 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0228  ferredoxin, PetF like protein  33.62 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08951  ferredoxin, PetF like protein  33.62 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104451  hitchhiker  0.000234569 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4862  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.07 
 
 
354 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.350242  normal  0.072998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  45.83 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  39.58 
 
 
268 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  39.6 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  37.36 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  37.37 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  36.73 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  38.38 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  35.42 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  41.38 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  38.82 
 
 
379 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16281  ferredoxin  31.48 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.311771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  39.08 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.82 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  34.74 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.48 
 
 
375 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  34.41 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  34.41 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  36.78 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.55 
 
 
375 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.55 
 
 
375 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.2 
 
 
382 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  35.29 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  37.78 
 
 
382 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.5 
 
 
352 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  35.48 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.2 
 
 
382 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.08 
 
 
382 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1122  oxidoreductase  44.44 
 
 
340 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14183  normal  0.242287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.08 
 
 
382 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  37.08 
 
 
382 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.56 
 
 
382 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  37.21 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.16 
 
 
386 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.18 
 
 
383 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  36.9 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1376  ferredoxin  40.45 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  32.99 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  37.5 
 
 
380 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  36.36 
 
 
380 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  36.36 
 
 
381 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.23 
 
 
381 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.23 
 
 
380 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.9 
 
 
385 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  35.23 
 
 
380 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>