More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2178 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 		 431 aa  833    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  75.6 
 
 		 420 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  60.77 
 
 		 441 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  51.58 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.25 
 
 		 440 aa  308  9e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  39.42 
 
 		 440 aa  302  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  30.09 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.84 
 
 		 413 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  28.44 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.32 
 
 		 472 aa  223  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  28.21 
 
 		 413 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.84 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  32.31 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  32.83 
 
 		 475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  33.93 
 
 		 489 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  34.94 
 
 		 566 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  33.25 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  33.25 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  37.22 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  37.22 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  33.58 
 
 		 462 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  33.78 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.84 
 
 		 457 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  35.78 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  32.59 
 
 		 481 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  31.02 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  33.12 
 
 		 529 aa  120  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.07 
 
 		 513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.49 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.32 
 
 		 517 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  30.89 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  29.32 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.34 
 
 		 529 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  28.66 
 
 		 516 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  29.84 
 
 		 506 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  26.48 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.47 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  28.43 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  28.1 
 
 		 531 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  28.34 
 
 		 545 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  27.84 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  26.02 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.76 
 
 		 496 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  26.94 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  22.58 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  25.95 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  24.31 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  25.39 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0183  small GTP-binding protein  38.93 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  25.31 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2529  hypothetical protein  26.6 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  38.71 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  29.17 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  35.71 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  36.13 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  35.56 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  37.1 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  29.17 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  25.12 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  29.17 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2604  GTP-binding protein EngA  34.97 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156486  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  37.42 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1243  small GTP-binding protein  35.88 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  44.19 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2152  small GTP-binding protein  37.19 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  36 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  36.23 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  27.01 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  35.1 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  28.74 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  28.57 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0473  small GTP-binding protein  34.33 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038153  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  27.89 
 
 		 461 aa  57  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0683  small GTP-binding protein  34.43 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00203334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1843  small GTP-binding protein  37.5 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0490  small GTP-binding protein  35.04 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0475  small GTP-binding protein  35.04 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  37.4 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5015  GTP-binding protein EngA  33.13 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  28.74 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  38.85 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1277  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.37 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038791  hitchhiker  0.00000385407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  28.21 
 
 		 1249 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  34.71 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.3 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  33.55 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  38.52 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1186  GTP-binding protein EngA  28.64 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  40.16 
 
 		 462 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0953  ribosome-associated GTPase EngA  31.91 
 
 		 437 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  34.96 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  37.1 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  35.37 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  31.58 
 
 		 473 aa  54.3  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2638  small GTP-binding protein  25 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  30.94 
 
 		 496 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  37.12 
 
 		 445 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3115  GTP-binding protein EngA  33.52 
 
 		 496 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>