17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2093 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2093  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.990572  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0578  hypothetical protein  79.81 
 
 
219 aa  345  3e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.976371  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05701  hypothetical protein  66.2 
 
 
218 aa  287  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13751  hypothetical protein  54.04 
 
 
200 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5132  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 
227 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3439  Beta-lactamase-like  36.55 
 
 
228 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254177  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2813  beta-lactamase-like protein  38.46 
 
 
226 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3287  hypothetical protein  38.46 
 
 
226 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0422328  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3896  beta-lactamase-like  34.01 
 
 
207 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.560821  normal  0.310182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  36.04 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4004  beta-lactamase-like protein  37.38 
 
 
246 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0417617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1706  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 
257 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.702666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.29 
 
 
204 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>