More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2072 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
366 aa  706  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  86.76 
 
 
353 aa  581  1e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  76.92 
 
 
362 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  66.49 
 
 
370 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  65.3 
 
 
376 aa  467  1e-130  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  68.84 
 
 
376 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  63.3 
 
 
376 aa  460  1e-128  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1583  trypsin-like serine protease  65.68 
 
 
376 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  63.01 
 
 
381 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  63.01 
 
 
381 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  51.91 
 
 
406 aa  336  3e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  3.57237e-08  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  51.34 
 
 
396 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  51.03 
 
 
411 aa  327  2e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  52.4 
 
 
394 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 
404 aa  318  7e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  50.44 
 
 
383 aa  318  8e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  50.44 
 
 
397 aa  318  8e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.14 
 
 
405 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.96 
 
 
410 aa  307  2e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  51.79 
 
 
351 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  49.86 
 
 
395 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  49.12 
 
 
377 aa  304  1e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  45.54 
 
 
415 aa  299  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  46.59 
 
 
380 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  43.73 
 
 
373 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  44.54 
 
 
424 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.43 
 
 
428 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  46.57 
 
 
385 aa  286  3e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01581  serine protease  46.75 
 
 
392 aa  285  7e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  42.69 
 
 
383 aa  284  1e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  45.32 
 
 
408 aa  284  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  44.94 
 
 
408 aa  284  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  45.22 
 
 
373 aa  284  2e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1456  PDZ/DHR/GLGF  46.75 
 
 
392 aa  284  2e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  44.93 
 
 
357 aa  283  3e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  45.4 
 
 
391 aa  282  5e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  44.22 
 
 
411 aa  282  6e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  46.06 
 
 
397 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  43.92 
 
 
418 aa  274  2e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  44.18 
 
 
402 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  44.71 
 
 
402 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  44.71 
 
 
402 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  45.16 
 
 
375 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08291  trypsin-like serine protease  46.55 
 
 
384 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.14 
 
 
405 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  41.85 
 
 
420 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  45.35 
 
 
392 aa  262  8e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.31 
 
 
387 aa  259  5e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.6 
 
 
415 aa  259  5e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.41 
 
 
401 aa  259  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.41562e-06  unclonable  1.45022e-07 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  40.92 
 
 
401 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.59 
 
 
478 aa  244  2e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  42.9 
 
 
372 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.76 
 
 
381 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  39.51 
 
 
464 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.6609e-07  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.3 
 
 
416 aa  238  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  38.71 
 
 
476 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.87 
 
 
472 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3211  predicted protein  40.76 
 
 
331 aa  236  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.37 
 
 
476 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.81376e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  36.63 
 
 
466 aa  232  8e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.36052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  39.44 
 
 
389 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40.24 
 
 
471 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  40.06 
 
 
396 aa  229  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  41.67 
 
 
387 aa  229  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  37.5 
 
 
459 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  37.5 
 
 
459 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.83 
 
 
457 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  38.46 
 
 
382 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  41.67 
 
 
402 aa  226  5e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  41.67 
 
 
388 aa  226  5e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  41.67 
 
 
402 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  41.67 
 
 
402 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  41.67 
 
 
402 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  41.67 
 
 
402 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.23 
 
 
513 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  36.16 
 
 
485 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  43.49 
 
 
412 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  42.81 
 
 
462 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  40.3 
 
 
489 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  2.25032e-08  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.14 
 
 
417 aa  223  5e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  42.9 
 
 
495 aa  223  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  41.39 
 
 
388 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  42.07 
 
 
385 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  40.56 
 
 
388 aa  222  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.48342e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.28 
 
 
475 aa  222  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.62 
 
 
500 aa  222  9e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  41.04 
 
 
398 aa  222  1e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  37.69 
 
 
476 aa  220  2e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.25 
 
 
474 aa  220  2e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.9 
 
 
398 aa  221  2e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.29 
 
 
458 aa  219  4e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  39.82 
 
 
485 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  40.63 
 
 
492 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  39.2 
 
 
504 aa  219  8e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  40.46 
 
 
383 aa  219  8e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  40.43 
 
 
407 aa  219  8e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.73 
 
 
401 aa  219  9e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  39.83 
 
 
402 aa  219  9e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  39.11 
 
 
403 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>