More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2068 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
262 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  84.73 
 
 
262 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  77.99 
 
 
277 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  70.43 
 
 
261 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  63.49 
 
 
263 aa  348  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  63.49 
 
 
263 aa  348  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16771  TatD family deoxyribonuclease  56.47 
 
 
264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1579  putative deoxyribonuclease, TatD family  56.86 
 
 
264 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  58.04 
 
 
264 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16901  TatD family deoxyribonuclease  56.08 
 
 
264 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  54.51 
 
 
273 aa  301  9e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1521  Sec-independent protein translocase TatD  55.86 
 
 
265 aa  291  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0926881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  54.44 
 
 
261 aa  282  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  51.36 
 
 
261 aa  274  9e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  51.76 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  51.76 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  55.04 
 
 
281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  50.98 
 
 
270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  43.89 
 
 
461 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  43.75 
 
 
268 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  40.84 
 
 
462 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  46.33 
 
 
259 aa  198  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  38.67 
 
 
256 aa  198  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  42.37 
 
 
606 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  42.47 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  44.53 
 
 
261 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  40.08 
 
 
255 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  43.63 
 
 
256 aa  191  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  41.63 
 
 
458 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  42.37 
 
 
462 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  45.53 
 
 
261 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.77 
 
 
457 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  42.41 
 
 
255 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  42.41 
 
 
256 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  43.58 
 
 
258 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  40.94 
 
 
270 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  44.02 
 
 
269 aa  184  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  44.02 
 
 
269 aa  184  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.26 
 
 
464 aa  184  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  41.44 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  43.02 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  40.47 
 
 
458 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  38.67 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  43.02 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  40.86 
 
 
255 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  44.31 
 
 
254 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  37.5 
 
 
255 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  43.63 
 
 
269 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  41.83 
 
 
262 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  37.89 
 
 
255 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  37.89 
 
 
255 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.89 
 
 
255 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.89 
 
 
255 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  37.89 
 
 
255 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.23 
 
 
263 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  38.67 
 
 
258 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.89 
 
 
255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  37.89 
 
 
255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  40.86 
 
 
255 aa  179  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  35.55 
 
 
260 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  42.31 
 
 
271 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  39.37 
 
 
260 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  39.38 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  41.02 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.5 
 
 
255 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  37.5 
 
 
255 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  40.78 
 
 
259 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  42.58 
 
 
256 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  40.31 
 
 
262 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  38.82 
 
 
260 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  38.91 
 
 
254 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  41.02 
 
 
258 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  37.11 
 
 
256 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  39.92 
 
 
257 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  41.63 
 
 
264 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
263 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.94 
 
 
256 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  41.25 
 
 
257 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.45 
 
 
256 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  41.22 
 
 
258 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  35.94 
 
 
255 aa  175  6e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  37.64 
 
 
261 aa  175  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  37.89 
 
 
257 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  39.15 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  39.15 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  40 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  38.82 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  36.92 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  39.62 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  43.56 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  36.43 
 
 
255 aa  171  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  32.68 
 
 
255 aa  171  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  38.13 
 
 
273 aa  171  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  43.56 
 
 
258 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  37.5 
 
 
271 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  40.53 
 
 
267 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  40.93 
 
 
262 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  40.38 
 
 
267 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  42.25 
 
 
262 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>