More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2036 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  64.35 
 
 
1161 aa  1575    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  100 
 
 
1162 aa  2432    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  37.24 
 
 
1061 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2165  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 
579 aa  188  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.88 
 
 
916 aa  181  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5486  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
398 aa  180  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1745  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
406 aa  168  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4803  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 
438 aa  162  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70984  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.61 
 
 
1366 aa  156  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2174  hypothetical protein  30.46 
 
 
404 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
327 aa  134  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
1297 aa  134  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  27.96 
 
 
751 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.96 
 
 
751 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3349  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
406 aa  124  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0542169  decreased coverage  0.00718656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3904  hypothetical protein  28.93 
 
 
413 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
1600 aa  116  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
846 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  31.76 
 
 
314 aa  105  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  31.76 
 
 
314 aa  105  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  31.76 
 
 
314 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
828 aa  102  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  30.83 
 
 
631 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  30 
 
 
314 aa  99  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
305 aa  98.2  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
309 aa  95.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
1236 aa  95.1  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  26.2 
 
 
513 aa  94.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
327 aa  92  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
327 aa  92  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
292 aa  90.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
308 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
305 aa  87.4  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  29.13 
 
 
606 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  30.43 
 
 
308 aa  87.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
308 aa  87.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
322 aa  87  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.43 
 
 
308 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
313 aa  86.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.83 
 
 
519 aa  85.5  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  29.31 
 
 
686 aa  84  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
306 aa  84.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
303 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  27.63 
 
 
695 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
507 aa  83.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  28.63 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.38 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.07 
 
 
303 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
273 aa  72  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 
666 aa  71.6  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 
581 aa  70.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  41.57 
 
 
324 aa  69.3  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
663 aa  68.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
306 aa  67.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  40.4 
 
 
1157 aa  67  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  39.56 
 
 
289 aa  67.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3545  glycosyltransferase  24.81 
 
 
391 aa  66.6  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 
235 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
304 aa  66.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.41 
 
 
322 aa  66.2  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.43 
 
 
340 aa  66.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
317 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.78 
 
 
351 aa  65.9  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.65 
 
 
700 aa  65.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 
289 aa  65.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
300 aa  65.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
477 aa  65.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
379 aa  65.1  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  35.4 
 
 
349 aa  65.1  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0719  putative sugar transferase  37.89 
 
 
331 aa  65.1  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
703 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
1301 aa  64.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
357 aa  64.3  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
310 aa  64.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
1082 aa  64.3  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  39.78 
 
 
334 aa  63.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3220  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
364 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  34.34 
 
 
403 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.99 
 
 
466 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  34.83 
 
 
341 aa  63.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
1250 aa  63.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  38.1 
 
 
1632 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.36 
 
 
337 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
321 aa  63.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
303 aa  63.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 
312 aa  63.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
311 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  38.1 
 
 
1806 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
365 aa  62.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
299 aa  63.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  29.38 
 
 
255 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
322 aa  62.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
305 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 
362 aa  62.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4199  glycosyl transferase family 2  36.78 
 
 
297 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
333 aa  62.4  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  33.33 
 
 
325 aa  62.4  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>