More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2035 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0634  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  80.27 
 
 
375 aa  641    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
378 aa  785    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08571  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  61.71 
 
 
358 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591053 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01181  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  60.62 
 
 
364 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.683798 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01521  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  55.96 
 
 
357 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.63 
 
 
357 aa  430  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.15 
 
 
353 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.75 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.81 
 
 
346 aa  414  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2711  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.74 
 
 
356 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.94 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.81 
 
 
352 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  55.52 
 
 
352 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.18 
 
 
353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5396  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.87 
 
 
360 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.24 
 
 
353 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.34 
 
 
353 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.14 
 
 
360 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.26 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1571  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.34 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  52.88 
 
 
359 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.24 
 
 
355 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.82 
 
 
350 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  52.76 
 
 
356 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.15 
 
 
359 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3502  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.4 
 
 
363 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.15 
 
 
359 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0180  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  51.09 
 
 
363 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1236  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 
344 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.443821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.07 
 
 
358 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 
358 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1183  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.96 
 
 
351 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.769877  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.21 
 
 
352 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0243  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  51.09 
 
 
363 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.82 
 
 
360 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03666  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.08 
 
 
355 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4188  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.08 
 
 
355 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03615  hypothetical protein  52.08 
 
 
355 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4152  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.8 
 
 
355 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.36 
 
 
358 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.29 
 
 
350 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3844  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.65 
 
 
346 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919278  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4133  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.78 
 
 
355 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2131  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.83 
 
 
358 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4148  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.78 
 
 
355 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  52.49 
 
 
360 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4310  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.78 
 
 
355 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.847685  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2992  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.19 
 
 
356 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.147327  normal  0.427533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.78 
 
 
358 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4078  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.93 
 
 
346 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29374  normal  0.0761668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.91 
 
 
354 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0103955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 
367 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 
355 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.39 
 
 
351 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4251  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.78 
 
 
355 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5221  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.67 
 
 
355 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1472  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.93 
 
 
356 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239272  normal  0.402949 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4215  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.52 
 
 
355 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4299  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.52 
 
 
355 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.36 
 
 
357 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.48 
 
 
355 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4029  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.48 
 
 
355 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.22 
 
 
355 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.52 
 
 
355 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.66 
 
 
365 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0516  dTDP-D-glucose-4,6-dehydratase  53.48 
 
 
355 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  52.6 
 
 
359 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.17 
 
 
353 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2663  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50.82 
 
 
362 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3054  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.11 
 
 
350 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2900  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  51.1 
 
 
358 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3306  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.93 
 
 
356 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.310142  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.23 
 
 
355 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4006  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.37 
 
 
355 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.09 
 
 
343 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3582  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.72 
 
 
342 aa  382  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2352  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.97 
 
 
352 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1212  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.89 
 
 
360 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  decreased coverage  0.00336065 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50 
 
 
371 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0544  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.11 
 
 
355 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0614  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.37 
 
 
356 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0278686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0701  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.76 
 
 
360 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.004629  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.57 
 
 
360 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50.54 
 
 
365 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3017  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.82 
 
 
340 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0758664 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.09 
 
 
350 aa  381  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  51.27 
 
 
361 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.18 
 
 
367 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2279  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50.42 
 
 
361 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000978054 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.29 
 
 
351 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01936  hypothetical protein  51.27 
 
 
361 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0773  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.24 
 
 
358 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0837  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.6 
 
 
361 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2330  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50.71 
 
 
361 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.129575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2323  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50.42 
 
 
361 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1683  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.56 
 
 
363 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.429769  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4198  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.09 
 
 
355 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2222  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  50.71 
 
 
361 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0048625  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3691  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.96 
 
 
352 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.139305  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1214  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.8 
 
 
351 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0108326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>