70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1972 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  100 
 
 		 381 aa  785    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  44.88 
 
 		 387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  42.43 
 
 		 495 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  42.65 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  40.28 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  39.72 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  40.97 
 
 		 375 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  40.28 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  40.11 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  39.04 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  40.06 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  36.65 
 
 		 436 aa  222  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  33.59 
 
 		 448 aa  193  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  32.31 
 
 		 471 aa  179  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  31.88 
 
 		 418 aa  179  7e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  29.35 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  28.72 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.14 
 
 		 359 aa  152  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  31.45 
 
 		 394 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.07 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  36 
 
 		 180 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  44 
 
 		 141 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.77 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  28.32 
 
 		 435 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  27.19 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  26.44 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  26.14 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  24.57 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  27.38 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  24.27 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  26.58 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  25.56 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  25.56 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  25.56 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  26.3 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  25.56 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  25.56 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  25.59 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  25.21 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  24.84 
 
 		 349 aa  57  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  25.75 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  31.85 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  23.1 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  24.91 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  22.18 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  21.31 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  23.13 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  20.96 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  23.73 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  34.09 
 
 		 358 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  24.79 
 
 		 286 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  26.92 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  21.2 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  34.29 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  25 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  21.38 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  24.14 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  23.79 
 
 		 349 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  32.84 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  33.93 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  20.33 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  20.33 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  31.34 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  23.4 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  23.22 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  23.45 
 
 		 424 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  27.91 
 
 		 317 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>