More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1945 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  100 
 
 		 124 aa  254  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  99.07 
 
 		 107 aa  219  9e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  95.33 
 
 		 107 aa  213  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  89.72 
 
 		 107 aa  207  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  89.72 
 
 		 107 aa  207  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  89.72 
 
 		 148 aa  205  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  85.98 
 
 		 107 aa  201  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  85.98 
 
 		 107 aa  201  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  85.98 
 
 		 107 aa  201  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  85.98 
 
 		 107 aa  200  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  77.57 
 
 		 107 aa  184  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  77.57 
 
 		 107 aa  183  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  73.83 
 
 		 109 aa  182  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  74.77 
 
 		 107 aa  180  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  75.7 
 
 		 107 aa  179  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  73.83 
 
 		 107 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  72.9 
 
 		 107 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  72.9 
 
 		 107 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  66.09 
 
 		 123 aa  177  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  74.26 
 
 		 125 aa  174  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  70.09 
 
 		 107 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  69.31 
 
 		 108 aa  164  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  74.47 
 
 		 110 aa  157  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  63 
 
 		 108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  62 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  62 
 
 		 108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  68.82 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  63.64 
 
 		 105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  57.84 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  59.41 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  58.49 
 
 		 110 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  63.27 
 
 		 107 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  60.75 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  58.49 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  57.58 
 
 		 110 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  59.41 
 
 		 109 aa  137  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  57.94 
 
 		 108 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  58.42 
 
 		 109 aa  136  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  57.94 
 
 		 109 aa  136  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  57.94 
 
 		 109 aa  136  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  57.69 
 
 		 105 aa  135  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  63.83 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  55.05 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  63.83 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  58.42 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  58.25 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  61.7 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  57 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  63.83 
 
 		 106 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  60.82 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  55.14 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  58.42 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  58.42 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  55.45 
 
 		 109 aa  133  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  58.42 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  59.57 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  50.98 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  61.39 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  54.29 
 
 		 107 aa  131  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  61.86 
 
 		 106 aa  131  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  56.31 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  56 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  55.67 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  54 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  56.44 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  58.1 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  54 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  59.57 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  51.96 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  53 
 
 		 109 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  57.84 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  52.94 
 
 		 109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  59.18 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  56 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  55.45 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  59.18 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  55 
 
 		 110 aa  129  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  53.92 
 
 		 106 aa  129  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  56.07 
 
 		 108 aa  129  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  54 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  59.18 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  54 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  53.47 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  60.64 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  55 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  57.43 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  58.76 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  58.42 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  57.43 
 
 		 110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  57.58 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  57.73 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  52.34 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>