21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1896 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  44.3 
 
 
159 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  41.14 
 
 
157 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  40.51 
 
 
157 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  39.46 
 
 
157 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  41.67 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  39.73 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  38 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  36.02 
 
 
159 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  36.67 
 
 
157 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  34.25 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  36.81 
 
 
180 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  38.46 
 
 
156 aa  98.2  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000534724  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  36.62 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  32.3 
 
 
159 aa  95.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  31.47 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  32.21 
 
 
169 aa  85.1  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  32.89 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  23.74 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1319  O-antigen related protein  33.82 
 
 
67 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0766792  normal  0.774627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>