28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1706 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  81.32 
 
 		 380 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  78.46 
 
 		 390 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  100 
 
 		 390 aa  812    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  66.07 
 
 		 386 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28561  hypothetical protein  69.61 
 
 		 105 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 404 aa  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12991  hypothetical protein  57.61 
 
 		 99 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0939  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  24.1 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  25.08 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  26.83 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  21.2 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  24.92 
 
 		 484 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13501  hypothetical protein  37.18 
 
 		 91 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.104266 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2571  phage integrase family protein  28.23 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  24.37 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  21.28 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  20.92 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  23.27 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 624 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  28.7 
 
 		 479 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  23.62 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  24.76 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  25.57 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.83 
 
 		 316 aa  43.1  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>