163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1600 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  100 
 
 
318 aa  598  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  81.45 
 
 
318 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  83.96 
 
 
323 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  41.02 
 
 
335 aa  216  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  38.92 
 
 
341 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  38.33 
 
 
362 aa  209  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  37.14 
 
 
350 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  37.58 
 
 
343 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  37.65 
 
 
350 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  37.58 
 
 
343 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  39.33 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  35.36 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  33.45 
 
 
300 aa  158  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  32.97 
 
 
298 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  32.97 
 
 
298 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  31.96 
 
 
346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  32.97 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  32.97 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  32.97 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  32.97 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  32.97 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  32.97 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  32.97 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  32.97 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  32.97 
 
 
298 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  34.91 
 
 
358 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  34.3 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  34.36 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  30.29 
 
 
325 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  32.27 
 
 
328 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  28.03 
 
 
371 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  29.56 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  32.27 
 
 
328 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  29.93 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  29.93 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  29.2 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  29.2 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  27.27 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  27.27 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  32.74 
 
 
288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  32.23 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  32.73 
 
 
524 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  26.6 
 
 
312 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  35.56 
 
 
334 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  35 
 
 
343 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  31.66 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  35.81 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  35.07 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  32.06 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  33.56 
 
 
368 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  30.5 
 
 
364 aa  106  7e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  26.15 
 
 
524 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  33.68 
 
 
352 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  26.69 
 
 
406 aa  82.4  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  27.97 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  45.71 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  27.12 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  28.47 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  26 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  26.82 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  27.04 
 
 
402 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  25.2 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  33.54 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  30.51 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  26 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.6 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  26.14 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  24.47 
 
 
324 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  30.79 
 
 
620 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.11 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  36.63 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  35.16 
 
 
475 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  26.01 
 
 
367 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  23.93 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  26.56 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  28.27 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  24.68 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  25.47 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  27.42 
 
 
296 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  32.2 
 
 
378 aa  55.8  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  25.93 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  26.78 
 
 
461 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  23.24 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  32.8 
 
 
474 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  21.54 
 
 
368 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  23.2 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  30.83 
 
 
433 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  29.25 
 
 
490 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  22.49 
 
 
300 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  21.18 
 
 
331 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  35.82 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  35.82 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  27.59 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  20.16 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  32.85 
 
 
433 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  33.33 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  21.03 
 
 
337 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  22.55 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  32.61 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  21.86 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>