114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1577 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1577  putative hydroxylase  100 
 
 
222 aa  457  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.572766  normal  0.0227046 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2001  putative hydroxylase  61.54 
 
 
222 aa  288  4e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.563142  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16191  putative hydroxylase  50.45 
 
 
221 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12561  putative hydroxylase  52.27 
 
 
221 aa  241  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131814 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0775  putative hydroxylase  50.45 
 
 
221 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20491  putative hydroxylase  52.7 
 
 
221 aa  234  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1262  putative hydroxylase  48.2 
 
 
221 aa  234  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13531  putative hydroxylase  48.65 
 
 
221 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13621  putative hydroxylase  47.96 
 
 
222 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.436442  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13321  putative hydroxylase  48.94 
 
 
189 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0015  putative hydroxylase  45.92 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal  0.457656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2258  putative hydroxylase  43.65 
 
 
222 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0352243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1929  putative hydroxylase  42.19 
 
 
220 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2196  putative hydroxylase  43.15 
 
 
222 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00771  putative hydroxylase  40.5 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2838  2OG-Fe(II) oxygenase  40.5 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00788  hypothetical protein  40.5 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0859  putative hydroxylase  40.5 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2839  putative hydroxylase  40.5 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.113073 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2548  putative hydroxylase  40 
 
 
225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2089  putative hydroxylase  39.01 
 
 
229 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0872  putative hydroxylase  40 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0828  putative hydroxylase  40 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1675  putative hydroxylase  37.04 
 
 
219 aa  136  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.899153  normal  0.0319364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3541  putative hydroxylase  40.39 
 
 
229 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3334  putative hydroxylase  37.67 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0690816  normal  0.437526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1514  putative hydroxylase  40 
 
 
229 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3968  putative hydroxylase  37.67 
 
 
229 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3244  putative hydroxylase  37.67 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054374  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0717  putative hydroxylase  37.67 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00266806  hitchhiker  0.000189122 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0953  putative hydroxylase  39.41 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0721  putative hydroxylase  37.67 
 
 
252 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000319663  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0750  putative hydroxylase  37.67 
 
 
252 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.904412  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3426  putative hydroxylase  35.94 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3913  putative hydroxylase  37.21 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0698  putative hydroxylase  37.67 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00417487  hitchhiker  0.000293405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1130  putative hydroxylase  36.57 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3634  putative hydroxylase  37.21 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0741  putative hydroxylase  37.21 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0366446  hitchhiker  0.0000066194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2273  putative hydroxylase  37.33 
 
 
227 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1313  putative hydroxylase  37.93 
 
 
209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325019  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0892  putative hydroxylase  39 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132513  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2559  putative hydroxylase  39 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3793  putative hydroxylase  38.61 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03560  putative hydroxylase  34.8 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3048  putative hydroxylase  36.77 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3557  putative hydroxylase  38.12 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4810  putative hydroxylase  38.12 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.63397  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5473  putative hydroxylase  38.12 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0632728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4714  putative hydroxylase  38.12 
 
 
227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.730869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4192  putative hydroxylase  38.12 
 
 
227 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540469  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0577  2OG-Fe(II) oxygenase  36.87 
 
 
225 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0176076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2812  putative hydroxylase  35.82 
 
 
226 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.192542  decreased coverage  0.000000224129 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7101  putative hydroxylase  37.09 
 
 
226 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1201  putative hydroxylase  38.61 
 
 
227 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2317  putative hydroxylase  35.75 
 
 
227 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000110026  hitchhiker  0.000149055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5374  putative hydroxylase  34.86 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983229  normal  0.422627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0792  putative hydroxylase  35.37 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182432  normal  0.929966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4479  putative hydroxylase  32.72 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1172  2OG-Fe(II) oxygenase  36.61 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7102  putative hydroxylase  32.74 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5004  putative hydroxylase  32.72 
 
 
227 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4316  putative hydroxylase  37.19 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0120702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0219  putative hydroxylase  34 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0037  2OG-Fe(II) oxygenase  40.49 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1709  putative hydroxylase  34.55 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.822877  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1949  2OG-Fe(II) oxygenase  34.55 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0612  2OG-Fe(II) oxygenase  32.89 
 
 
226 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240573  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0838  putative hydroxylase  35.71 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143447 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1690  putative hydroxylase  37.13 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1609  putative hydroxylase  37.13 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0905  putative hydroxylase  36.68 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0045  putative hydroxylase  37.5 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0200  putative hydroxylase  37.13 
 
 
227 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0103343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12420  putative hydroxylase  35.05 
 
 
226 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.455137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3725  hypothetical protein  36.92 
 
 
251 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.780792 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1638  putative hydroxylase  34.86 
 
 
230 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3575  putative hydroxylase  33.5 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.574336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2877  putative hydroxylase  32.75 
 
 
228 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0803  putative hydroxylase  36.87 
 
 
222 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4046  putative hydroxylase  37.5 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0892  putative hydroxylase  36.18 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.137748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0862  putative hydroxylase  36.18 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1809  2OG-Fe(II) oxygenase  37.77 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3078  putative hydroxylase  33.48 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2199  2OG-Fe(II) oxygenase  37.65 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.568044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0099  2OG-Fe(II) oxygenase  36.6 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0990  2OG-Fe(II) oxygenase  36.2 
 
 
225 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.20118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0528  putative hydroxylase  37.37 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3916  putative hydroxylase  34.4 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.721944  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3803  putative hydroxylase  34.4 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.327184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0799  putative hydroxylase  36.82 
 
 
226 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1077  putative hydroxylase  34.56 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0236  2OG-Fe(II) oxygenase  37.79 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.740629  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58580  putative hydroxylase  36.76 
 
 
226 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00121484  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5129  putative hydroxylase  36.32 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482297  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0106  2OG-Fe(II) oxygenase  36.6 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0512  putative hydroxylase  37.71 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.647783  normal  0.011367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3084  putative hydroxylase  33.77 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.418159  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4660  putative hydroxylase  36.02 
 
 
227 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>