More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1438 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.89 
 
 
612 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  54.55 
 
 
617 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.71 
 
 
640 aa  743    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.16 
 
 
628 aa  932    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  80.91 
 
 
637 aa  1073    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.05 
 
 
631 aa  773    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  86.05 
 
 
638 aa  1083    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  79.15 
 
 
640 aa  1048    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  54.46 
 
 
613 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  66.27 
 
 
633 aa  777    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  72.57 
 
 
628 aa  949    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  91.74 
 
 
642 aa  1129    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  100 
 
 
639 aa  1285    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  54.62 
 
 
617 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  80.44 
 
 
637 aa  1070    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  55.2 
 
 
613 aa  656    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  74.45 
 
 
630 aa  971    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  62.32 
 
 
632 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.4 
 
 
632 aa  924    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  54.3 
 
 
617 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  80.44 
 
 
637 aa  1064    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.16 
 
 
628 aa  906    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.84 
 
 
655 aa  748    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.16 
 
 
628 aa  906    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  53.88 
 
 
619 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.71 
 
 
640 aa  743    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  60.39 
 
 
632 aa  725    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.62 
 
 
628 aa  927    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  78.39 
 
 
637 aa  1046    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  58.01 
 
 
667 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  58.36 
 
 
613 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  73.04 
 
 
628 aa  949    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.33 
 
 
613 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  80.82 
 
 
637 aa  1073    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  79.31 
 
 
640 aa  1051    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.76 
 
 
631 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  56.77 
 
 
602 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.64 
 
 
616 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.94 
 
 
616 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.94 
 
 
616 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  54.6 
 
 
617 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  54.44 
 
 
616 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  53.27 
 
 
615 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  53.27 
 
 
615 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  57.74 
 
 
615 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  53.37 
 
 
619 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  50 
 
 
616 aa  578  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.91 
 
 
598 aa  568  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  61.34 
 
 
599 aa  567  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  52.84 
 
 
651 aa  565  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.81 
 
 
630 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.95 
 
 
602 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.89 
 
 
615 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  50.66 
 
 
627 aa  560  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48 
 
 
608 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.96 
 
 
632 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.27 
 
 
639 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.51 
 
 
640 aa  552  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 
643 aa  555  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.6 
 
 
630 aa  552  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.21 
 
 
638 aa  555  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  56.88 
 
 
633 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  56.88 
 
 
633 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  56.88 
 
 
633 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  56.88 
 
 
633 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.38 
 
 
651 aa  549  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.15 
 
 
610 aa  549  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  56.88 
 
 
633 aa  549  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.26 
 
 
635 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.75 
 
 
651 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  56.88 
 
 
633 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  56.67 
 
 
633 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  56.88 
 
 
633 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  56.67 
 
 
633 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.49 
 
 
656 aa  547  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  46.29 
 
 
639 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  46.29 
 
 
639 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.15 
 
 
610 aa  548  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.32 
 
 
639 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.83 
 
 
640 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.98 
 
 
657 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  46.92 
 
 
681 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.25 
 
 
633 aa  542  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.81 
 
 
621 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.91 
 
 
611 aa  542  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  48.64 
 
 
693 aa  545  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.39 
 
 
640 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  48.79 
 
 
645 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  46.55 
 
 
638 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  50.65 
 
 
673 aa  539  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  48.47 
 
 
641 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.24 
 
 
642 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.79 
 
 
645 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.39 
 
 
640 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  47.34 
 
 
659 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.51 
 
 
655 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.2 
 
 
645 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.15 
 
 
640 aa  537  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  47.73 
 
 
649 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.9 
 
 
637 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>