More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1388 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1388  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
186 aa  374  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  65.05 
 
 
230 aa  252  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0394188  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.46 
 
 
250 aa  232  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.165078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.06 
 
 
214 aa  214  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.5 
 
 
214 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.81 
 
 
213 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4633  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.11 
 
 
239 aa  209  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.614886  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0564  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.5 
 
 
218 aa  205  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513649  normal  0.0898016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0039  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.19 
 
 
225 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.03 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.779009  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.81 
 
 
212 aa  194  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.16 
 
 
232 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.85 
 
 
232 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.81 
 
 
410 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.59 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
206 aa  168  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.3 
 
 
208 aa  166  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.16 
 
 
206 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.58 
 
 
194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.65 
 
 
225 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.65 
 
 
225 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.04 
 
 
223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.3 
 
 
214 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.69 
 
 
224 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.2 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.09 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.05 
 
 
206 aa  161  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48 
 
 
219 aa  161  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.57 
 
 
219 aa  161  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.43 
 
 
222 aa  161  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.02 
 
 
211 aa  160  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48 
 
 
219 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.38 
 
 
205 aa  159  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.02 
 
 
204 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.59 
 
 
202 aa  158  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.96 
 
 
199 aa  158  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1649  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.13 
 
 
197 aa  157  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.318783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
221 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.59 
 
 
220 aa  157  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.02 
 
 
220 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.4 
 
 
217 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
204 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.73 
 
 
221 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.3 
 
 
218 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.02 
 
 
213 aa  155  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.505321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.94 
 
 
206 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.57 
 
 
209 aa  154  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.54 
 
 
195 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
202 aa  154  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.75 
 
 
222 aa  154  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5372  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.45 
 
 
192 aa  153  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.54 
 
 
195 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.54 
 
 
195 aa  153  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.54 
 
 
195 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.54 
 
 
195 aa  153  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.54 
 
 
195 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.54 
 
 
195 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.86 
 
 
215 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.48 
 
 
210 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.02 
 
 
195 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.75 
 
 
225 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.07 
 
 
210 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.75 
 
 
214 aa  152  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.02 
 
 
195 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.59 
 
 
206 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09681  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.55 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.18 
 
 
203 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.75 
 
 
214 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.38 
 
 
205 aa  151  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.2 
 
 
218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.18 
 
 
221 aa  151  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.61 
 
 
222 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.43 
 
 
212 aa  150  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.11 
 
 
195 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.16 
 
 
216 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.07 
 
 
200 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.75 
 
 
222 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.61 
 
 
222 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.81 
 
 
216 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
213 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.34 
 
 
196 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000428099  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.11 
 
 
207 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.02 
 
 
229 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.67 
 
 
206 aa  149  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0276  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.92 
 
 
195 aa  148  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.55 
 
 
217 aa  148  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.02 
 
 
205 aa  148  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.51 
 
 
203 aa  148  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.2 
 
 
222 aa  148  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.62 
 
 
212 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.62 
 
 
212 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.62 
 
 
212 aa  147  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.02 
 
 
245 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.61 
 
 
216 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.02 
 
 
220 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.71 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.02 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.02 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.59 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.98 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>