More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1356 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  90.76 
 
 
304 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  85.81 
 
 
306 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  76.24 
 
 
304 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  75.91 
 
 
304 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  75.58 
 
 
304 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  73.93 
 
 
304 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  72.94 
 
 
304 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  72.94 
 
 
304 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  74.26 
 
 
305 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  69.31 
 
 
304 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  63.04 
 
 
304 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  63.04 
 
 
304 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  65.02 
 
 
304 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  63.04 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 
302 aa  251  8.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  42.52 
 
 
322 aa  241  9e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  40.91 
 
 
310 aa  235  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  40.79 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  40.67 
 
 
307 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  37.46 
 
 
311 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  38.54 
 
 
322 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  39.33 
 
 
306 aa  229  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  39 
 
 
306 aa  228  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
303 aa  224  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
305 aa  223  4e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 
303 aa  219  6e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
312 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  38.28 
 
 
307 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  38.46 
 
 
306 aa  205  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  37.29 
 
 
307 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  37.38 
 
 
307 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 
307 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  34.98 
 
 
312 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  37.21 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  37.29 
 
 
307 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  37.29 
 
 
307 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  37.29 
 
 
307 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  37.05 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 
307 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  36.88 
 
 
307 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  35.31 
 
 
313 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
307 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  36.07 
 
 
306 aa  195  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  35.79 
 
 
306 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  36.72 
 
 
307 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  36.66 
 
 
310 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  34.32 
 
 
312 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  35.74 
 
 
313 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  35.22 
 
 
311 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
307 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  37.21 
 
 
306 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  37.04 
 
 
311 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  35.9 
 
 
306 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  34.87 
 
 
307 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  34.87 
 
 
307 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  37.17 
 
 
339 aa  192  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
312 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  36.07 
 
 
307 aa  192  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
308 aa  192  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  34.87 
 
 
309 aa  191  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  36.88 
 
 
317 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  33.88 
 
 
316 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 
307 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  34.53 
 
 
308 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  34.53 
 
 
308 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  34.53 
 
 
308 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  33.99 
 
 
307 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 
309 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
303 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  35.43 
 
 
307 aa  188  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  36.51 
 
 
304 aa  189  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 
312 aa  189  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 
304 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 
307 aa  188  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
304 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  32.57 
 
 
317 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  34.1 
 
 
308 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
306 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  34.43 
 
 
309 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  36.12 
 
 
307 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  37.42 
 
 
317 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  36.42 
 
 
303 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  35.86 
 
 
304 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  36.42 
 
 
304 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  35.55 
 
 
307 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  37.17 
 
 
319 aa  185  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>