More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1337 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 73 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 73 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  95.89 
 
 		 73 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  87.67 
 
 		 73 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  87.67 
 
 		 73 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  89.04 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  89.04 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  89.04 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  89.04 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  89.04 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  80 
 
 		 71 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  80 
 
 		 71 aa  122  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  81.43 
 
 		 71 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  74.65 
 
 		 72 aa  120  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  77.14 
 
 		 71 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  77.14 
 
 		 71 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  75.71 
 
 		 71 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  75.71 
 
 		 71 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  71.43 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  75.93 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  75.93 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  70.37 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  73.08 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  72.55 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  70.37 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  70.37 
 
 		 76 aa  80.5  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  68.52 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  68.52 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  62.07 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  62.07 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  67.92 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  65.38 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  62.26 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  60.38 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  70 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  58.49 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  60.38 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  58.49 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  60.78 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  64.71 
 
 		 74 aa  73.6  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  44.59 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  44.59 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  65.38 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  47.3 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  59.62 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3119  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.258718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  59.26 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  63.46 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03777  30S ribosomal protein S18  57.41 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  62.75 
 
 		 70 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 82 aa  72  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  64.81 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  61.11 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3745  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00458678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  64.71 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  45.95 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  62.75 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0889  SSU ribosomal protein S18P  57.41 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  68 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  59.62 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  55.36 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0413  30S ribosomal protein S18  58.18 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  59.26 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3941  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4309  30S ribosomal protein S18  56.86 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685461 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>