More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1322 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  83.11 
 
 		 599 aa  969    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 598 aa  1189    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  58.94 
 
 		 632 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14591  cell division protein FtsH4  73.06 
 
 		 619 aa  847    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.584936 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  58.02 
 
 		 577 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  51.93 
 
 		 584 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.87 
 
 		 584 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  52.51 
 
 		 584 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  54.03 
 
 		 575 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  54.03 
 
 		 575 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  55.38 
 
 		 628 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.86 
 
 		 628 aa  603  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  51.16 
 
 		 584 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.33 
 
 		 632 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3253  FtsH peptidase  54.77 
 
 		 667 aa  595  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.67 
 
 		 631 aa  593  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.3 
 
 		 637 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3590  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.17 
 
 		 631 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  52.62 
 
 		 633 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  54.48 
 
 		 628 aa  591  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.33 
 
 		 628 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.55 
 
 		 628 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  51.91 
 
 		 639 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  52.12 
 
 		 637 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.01 
 
 		 640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.01 
 
 		 640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.55 
 
 		 628 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.35 
 
 		 655 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  52.79 
 
 		 637 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  53.49 
 
 		 642 aa  581  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  52.61 
 
 		 637 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  52.61 
 
 		 637 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.3 
 
 		 640 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  53.3 
 
 		 640 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  54.36 
 
 		 630 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  53.65 
 
 		 638 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  52.73 
 
 		 602 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  52.2 
 
 		 617 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  52.39 
 
 		 613 aa  557  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  52.2 
 
 		 617 aa  558  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  51.84 
 
 		 619 aa  555  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  51.94 
 
 		 617 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  51.92 
 
 		 615 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.19 
 
 		 616 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  51.59 
 
 		 615 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.66 
 
 		 616 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.66 
 
 		 616 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03061  cell division protein FtsH2  51.59 
 
 		 615 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  51.75 
 
 		 617 aa  538  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  51.58 
 
 		 616 aa  538  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  51.68 
 
 		 613 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.68 
 
 		 612 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  50.52 
 
 		 613 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 		 613 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.68 
 
 		 638 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  48.43 
 
 		 651 aa  508  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.09 
 
 		 640 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.76 
 
 		 619 aa  504  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  54.31 
 
 		 632 aa  502  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.95 
 
 		 615 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.03 
 
 		 611 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.28 
 
 		 651 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  48.25 
 
 		 616 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.45 
 
 		 643 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.97 
 
 		 599 aa  496  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.94 
 
 		 656 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.47 
 
 		 759 aa  494  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.75 
 
 		 639 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17504  predicted protein  45.33 
 
 		 673 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.32 
 
 		 655 aa  492  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.63 
 
 		 657 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  45.98 
 
 		 659 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.49 
 
 		 602 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.27 
 
 		 610 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.17 
 
 		 635 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.38 
 
 		 632 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.17 
 
 		 607 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  48.88 
 
 		 639 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.93 
 
 		 610 aa  488  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.43 
 
 		 640 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  45.73 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  45.64 
 
 		 633 aa  482  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  48.63 
 
 		 628 aa  485  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  45.73 
 
 		 633 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  45.73 
 
 		 633 aa  485  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  45.73 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  45.73 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  45.73 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.03 
 
 		 652 aa  482  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.99 
 
 		 621 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  45.73 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  45.73 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.35 
 
 		 628 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  46.91 
 
 		 637 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.18 
 
 		 628 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.17 
 
 		 639 aa  485  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.56 
 
 		 650 aa  482  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.01 
 
 		 657 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.52 
 
 		 697 aa  482  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.86 
 
 		 656 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>