237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1247 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  100 
 
 		 386 aa  770    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  55.61 
 
 		 403 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  55.03 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  52.52 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  45.55 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  46.07 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  45.38 
 
 		 400 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  45.83 
 
 		 395 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  46.09 
 
 		 395 aa  355  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  41.44 
 
 		 386 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  35.9 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  35.94 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  35.9 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  35.9 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  34.32 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  35.39 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  36.21 
 
 		 393 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  36.21 
 
 		 393 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  33.24 
 
 		 434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  33.42 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  34.3 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  32.56 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  30.14 
 
 		 356 aa  166  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.7 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.85 
 
 		 1040 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.81 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  26 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.38 
 
 		 792 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.53 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.75 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  25.94 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  24.62 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.47 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 359 aa  90.5  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.81 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  26.19 
 
 		 361 aa  89.7  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  20.81 
 
 		 1096 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.92 
 
 		 1111 aa  87.8  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 1061 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  23.34 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 1061 aa  83.6  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  21.12 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.46 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.9 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  28.46 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.9 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 		 1153 aa  79.7  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.84 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.17 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  20.05 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.53 
 
 		 359 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  23.49 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.94 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  23.06 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  21.7 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.41 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  22.22 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  21.92 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  19.76 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.34 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  21.71 
 
 		 358 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  22.14 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  25.26 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  21.74 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  24.24 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  25.85 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  21.22 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1655  hypothetical protein  22.46 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0670  hypothetical protein  22.46 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144259  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1020  hypothetical protein  22.46 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1173  hypothetical protein  22.46 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0049  permease YjgP/YjgQ  24.37 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1013  hypothetical protein  22.46 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2341  hypothetical protein  22.46 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2944  hypothetical protein  22.46 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  21.64 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>