More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1242 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  45.71 
 
 
852 aa  682    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  46.12 
 
 
837 aa  715    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  74.91 
 
 
851 aa  1238    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  47.78 
 
 
835 aa  717    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  100 
 
 
843 aa  1682    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  48.27 
 
 
823 aa  707    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  45.27 
 
 
835 aa  634  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  42.62 
 
 
877 aa  594  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  42.81 
 
 
833 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  42.05 
 
 
847 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  37.82 
 
 
826 aa  533  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  40.45 
 
 
841 aa  527  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  32.82 
 
 
847 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  35.69 
 
 
838 aa  362  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  31.21 
 
 
848 aa  357  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  30.02 
 
 
839 aa  344  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  34.02 
 
 
835 aa  332  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  30.4 
 
 
810 aa  318  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  31.97 
 
 
836 aa  317  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  29.74 
 
 
886 aa  317  7e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  29.6 
 
 
835 aa  310  8e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  30.2 
 
 
783 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  30.8 
 
 
872 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  39.16 
 
 
862 aa  305  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  27.14 
 
 
783 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  26.83 
 
 
783 aa  298  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  33.25 
 
 
840 aa  296  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  30.31 
 
 
828 aa  290  9e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  28.99 
 
 
767 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  28.24 
 
 
826 aa  280  8e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  32.24 
 
 
832 aa  280  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  31.42 
 
 
873 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  38.56 
 
 
805 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  25.64 
 
 
817 aa  267  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  30.7 
 
 
825 aa  266  8.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  34.73 
 
 
839 aa  265  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  43.04 
 
 
783 aa  253  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  33.27 
 
 
790 aa  241  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  31.9 
 
 
878 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  35.74 
 
 
818 aa  237  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  29.22 
 
 
716 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  32.66 
 
 
834 aa  235  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  33.78 
 
 
654 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  31.6 
 
 
723 aa  232  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  33.78 
 
 
654 aa  232  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  33.78 
 
 
654 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  33.77 
 
 
666 aa  231  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  33.78 
 
 
654 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  33.01 
 
 
653 aa  230  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  33.78 
 
 
654 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  33.01 
 
 
653 aa  230  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  33.33 
 
 
653 aa  230  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  33.01 
 
 
667 aa  230  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  33.01 
 
 
667 aa  230  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  33.01 
 
 
667 aa  230  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  33.27 
 
 
654 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.156367 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  32.82 
 
 
653 aa  229  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  32.82 
 
 
667 aa  229  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  29.87 
 
 
621 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  30.93 
 
 
622 aa  227  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  38.17 
 
 
792 aa  227  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  38.17 
 
 
790 aa  226  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  33.14 
 
 
790 aa  225  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  32.89 
 
 
635 aa  224  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  32.5 
 
 
629 aa  224  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  34.48 
 
 
746 aa  224  4.9999999999999996e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  31.21 
 
 
792 aa  224  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  26.62 
 
 
722 aa  223  9e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  33.78 
 
 
668 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  28.91 
 
 
736 aa  220  7e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  32.14 
 
 
790 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  32.1 
 
 
668 aa  217  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  33.65 
 
 
822 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  36.14 
 
 
413 aa  214  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  39.68 
 
 
404 aa  213  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  32.09 
 
 
655 aa  212  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3705  peptidase U32  33.46 
 
 
638 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  36.65 
 
 
409 aa  213  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3582  peptidase U32  33.65 
 
 
638 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  31.78 
 
 
637 aa  212  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0734  peptidase U32  33.65 
 
 
638 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  32.05 
 
 
639 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  39.81 
 
 
430 aa  211  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  33.65 
 
 
638 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3497  U32 family peptidase  32.51 
 
 
666 aa  211  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  32.51 
 
 
666 aa  211  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  36.34 
 
 
409 aa  210  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1589  peptidase U32  32.89 
 
 
667 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  31.76 
 
 
641 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  40.34 
 
 
747 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2285  peptidase U32  32.95 
 
 
692 aa  208  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.437271  normal  0.0318374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  38.55 
 
 
696 aa  208  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  38.77 
 
 
420 aa  208  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  31.2 
 
 
652 aa  208  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  32.06 
 
 
638 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  32.25 
 
 
669 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  27.91 
 
 
805 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  32.06 
 
 
638 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  32.26 
 
 
649 aa  206  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0800  peptidase U32  32.51 
 
 
638 aa  206  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>