264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1240 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  74.88 
 
 
405 aa  638  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  74.88 
 
 
405 aa  637  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  6.08264e-05  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  92.75 
 
 
452 aa  875  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
455 aa  939  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  81 
 
 
446 aa  709  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  73.92 
 
 
457 aa  640  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  79.81 
 
 
446 aa  704  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  81.24 
 
 
449 aa  694  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  78.77 
 
 
468 aa  709  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  80.29 
 
 
446 aa  707  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  75.28 
 
 
445 aa  660  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  74.89 
 
 
443 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  74.82 
 
 
418 aa  632  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  74.89 
 
 
443 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  74.08 
 
 
406 aa  629  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  73.41 
 
 
405 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  74.08 
 
 
406 aa  619  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  72.86 
 
 
407 aa  613  1e-174  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  65.36 
 
 
462 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  63.12 
 
 
463 aa  506  1e-142  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  42.18 
 
 
421 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  41.23 
 
 
406 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  41.04 
 
 
406 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  43.1 
 
 
379 aa  290  5e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  40.93 
 
 
379 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  41.73 
 
 
380 aa  273  4e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  40.1 
 
 
380 aa  270  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  41.23 
 
 
380 aa  269  8e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  39.76 
 
 
380 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  39.86 
 
 
380 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  38.67 
 
 
400 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  38.38 
 
 
400 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  39.23 
 
 
401 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  38.85 
 
 
394 aa  234  2e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  38.27 
 
 
394 aa  234  2e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  38.27 
 
 
394 aa  234  2e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  37.47 
 
 
400 aa  233  4e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  37.26 
 
 
405 aa  229  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  38.27 
 
 
394 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  36.97 
 
 
397 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  36.68 
 
 
393 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  36.18 
 
 
402 aa  219  8e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  38.26 
 
 
397 aa  219  9e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  37.57 
 
 
397 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  34.88 
 
 
403 aa  214  4e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  34.1 
 
 
408 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  35.43 
 
 
399 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  33.72 
 
 
330 aa  183  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  33.5 
 
 
413 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.5 
 
 
378 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.24296e-05 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 
375 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  27.74 
 
 
387 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 
381 aa  99.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 
395 aa  89.7  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.95 
 
 
389 aa  88.6  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 
390 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.4 
 
 
396 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 
424 aa  86.7  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  25.2 
 
 
374 aa  84.7  3e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 
382 aa  84  5e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.67 
 
 
384 aa  84  5e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 
399 aa  83.6  6e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 
396 aa  83.2  9e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 
425 aa  81.6  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 
396 aa  81.6  3e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.99674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.1 
 
 
382 aa  81.3  3e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 
379 aa  81.6  3e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 
384 aa  81.3  4e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 
391 aa  80.9  4e-14  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 
423 aa  80.5  6e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 
368 aa  79.7  1e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 
418 aa  78.6  2e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 
434 aa  79  2e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.4 
 
 
435 aa  78.6  2e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.2 
 
 
408 aa  78.2  3e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 
362 aa  77  6e-13  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  7.05466e-05 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
348 aa  76.3  1e-12  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 
423 aa  74.7  3e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 
374 aa  74.3  4e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 
431 aa  74.7  4e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 
402 aa  74.3  4e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 
403 aa  73.6  6e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 
341 aa  73.9  6e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 
385 aa  73.6  6e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 
382 aa  72  2e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 
387 aa  72  2e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 
402 aa  71.6  3e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  24.08 
 
 
398 aa  71.2  3e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 
423 aa  71.2  4e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 
365 aa  70.5  6e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 
393 aa  70.1  7e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 
370 aa  70.1  7e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  24.59 
 
 
379 aa  70.1  8e-11  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 
375 aa  69.7  9e-11  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 
393 aa  68.6  2e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  23.98 
 
 
383 aa  68.6  2e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>