66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1109 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 362 aa  737    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  67.31 
 
 		 362 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  71.39 
 
 		 365 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  58.66 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  58.66 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  59.1 
 
 		 356 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  57.82 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  56.7 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  56.98 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  55.83 
 
 		 360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  54.5 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  54.17 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  54.52 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  56.7 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  56.66 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  51.53 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  45 
 
 		 374 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  48.29 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  42.4 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  26 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  24.17 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  26.34 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  26.34 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  25.93 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 314 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  24.89 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  24.67 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  22.75 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  23.9 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6000  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  29.52 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  22.22 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  21.29 
 
 		 383 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 		 375 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  27.64 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  21.46 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  27.61 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.38 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  26.78 
 
 		 618 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  24.84 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  22.68 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  26.99 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  30.86 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  22.68 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  26.05 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  28.49 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  28.49 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  29.15 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>