More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1080 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  60.27 
 
 		 224 aa  288  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  56.34 
 
 		 277 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  51.17 
 
 		 217 aa  221  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  52.13 
 
 		 276 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  51.17 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  51.66 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  49.01 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  47.91 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 269 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  51.66 
 
 		 303 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  47.32 
 
 		 352 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2527  hydrogenase accessory protein HypB  52.09 
 
 		 407 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455957  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  48.61 
 
 		 303 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  49.1 
 
 		 394 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  50.99 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  51.16 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 307 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  44.29 
 
 		 284 aa  208  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 273 aa  208  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 273 aa  208  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  51.43 
 
 		 263 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 288 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  46.19 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  50.47 
 
 		 225 aa  208  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  50.48 
 
 		 294 aa  207  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  51.43 
 
 		 261 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  51.43 
 
 		 261 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  50.5 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  48.64 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  50.93 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  49.76 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  49.5 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  49.1 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  51.17 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  49.32 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 284 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  48.91 
 
 		 281 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  49.03 
 
 		 253 aa  204  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  53.27 
 
 		 308 aa  204  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 319 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  50.48 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  46.48 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  48.54 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  50.48 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  48.51 
 
 		 267 aa  203  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  50.45 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  53.62 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  50.73 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  47.09 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  48.21 
 
 		 312 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  47.89 
 
 		 278 aa  201  6e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  46.08 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  47.76 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  50.24 
 
 		 277 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 219 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  48.82 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  48.82 
 
 		 305 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  49.11 
 
 		 280 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  45.16 
 
 		 292 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  47.42 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  45.12 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  45.12 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  47.09 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  47.09 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2482  hydrogenase accessory protein HypB  49.05 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  49.03 
 
 		 322 aa  198  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  47.76 
 
 		 270 aa  197  7.999999999999999e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  48.36 
 
 		 258 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 267 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  50.7 
 
 		 268 aa  197  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  47.25 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  47.44 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  50.48 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  47.66 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.31 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.31 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.31 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.31 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1765  hydrogenase accessory protein HypB  45.71 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1963  hydrogenase accessory protein HypB  44.35 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  51.81 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  47.17 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  49.03 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  46.86 
 
 		 253 aa  194  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  49.29 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  48.79 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.79 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  48.79 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  49.51 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  48.85 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>