More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1030 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  100 
 
 
511 aa  998  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  80.23 
 
 
524 aa  776  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0594  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  78.38 
 
 
512 aa  768  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.926621  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0931  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  89.78 
 
 
504 aa  838  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.743179  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18571  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  81.76 
 
 
523 aa  803  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.960985 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  79.19 
 
 
513 aa  748  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10561  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  75.45 
 
 
523 aa  770  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06591  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  79.39 
 
 
512 aa  746  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06201  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  78.79 
 
 
513 aa  745  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  80.43 
 
 
524 aa  775  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1439  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  61.92 
 
 
533 aa  603  1e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  55.76 
 
 
537 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1516  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  55.94 
 
 
538 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  54.75 
 
 
534 aa  546  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02221  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  56.14 
 
 
538 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2401  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  55.85 
 
 
533 aa  541  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01691  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  54.84 
 
 
531 aa  539  1e-152  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588128  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1976  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  54.9 
 
 
534 aa  540  1e-152  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.304394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5216  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  54.75 
 
 
531 aa  540  1e-152  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01671  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  54.76 
 
 
534 aa  540  1e-152  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0152  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  54.96 
 
 
534 aa  540  1e-152  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  53.86 
 
 
524 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  55.31 
 
 
532 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63526e-09 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1745  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  53.13 
 
 
525 aa  534  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0659  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.12 
 
 
527 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.79601  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.6 
 
 
537 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4388  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.73 
 
 
526 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4450  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.73 
 
 
526 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.487224 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26711  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  55.85 
 
 
563 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2308  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.01 
 
 
561 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0292  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  55.12 
 
 
548 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  51.91 
 
 
560 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01651  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  56.25 
 
 
558 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.398618  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  51.91 
 
 
560 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4656  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  51.8 
 
 
561 aa  518  1e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000336952 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01781  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  54.44 
 
 
546 aa  518  1e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  52.2 
 
 
563 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  53.44 
 
 
561 aa  506  1e-142  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.61 
 
 
497 aa  338  1e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.56 
 
 
497 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0970  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.38 
 
 
545 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0643  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.78 
 
 
544 aa  329  9e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.22 
 
 
545 aa  328  1e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.511316  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.42 
 
 
525 aa  327  4e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.260264  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.71 
 
 
545 aa  327  4e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.33 
 
 
517 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.24 
 
 
544 aa  324  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_803  NADH:quinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  40.95 
 
 
497 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.93 
 
 
545 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.87 
 
 
545 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  40.95 
 
 
497 aa  323  5e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  37.55 
 
 
513 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.85 
 
 
507 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1606  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.36 
 
 
496 aa  317  4e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  35.93 
 
 
502 aa  315  1e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.35 
 
 
549 aa  315  1e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137682  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1268  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.14 
 
 
549 aa  314  3e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.23 
 
 
495 aa  313  5e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.68 
 
 
503 aa  313  5e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.05 
 
 
491 aa  312  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  36.86 
 
 
515 aa  312  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.75 
 
 
503 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2580  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.56 
 
 
549 aa  310  3e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  37.45 
 
 
502 aa  310  3e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  36.44 
 
 
510 aa  310  3e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.51 
 
 
525 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0609  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.24 
 
 
496 aa  310  5e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.93 
 
 
519 aa  310  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.81 
 
 
509 aa  310  6e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  35.94 
 
 
502 aa  310  6e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  38.37 
 
 
502 aa  309  6e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  36.06 
 
 
514 aa  309  7e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  37.17 
 
 
513 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  35.74 
 
 
502 aa  306  4e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  38.17 
 
 
505 aa  306  5e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  36.44 
 
 
522 aa  305  1e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1620  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.71 
 
 
503 aa  304  3e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  36.61 
 
 
504 aa  304  3e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.27 
 
 
495 aa  304  3e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  37.18 
 
 
505 aa  303  6e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0349  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  39.68 
 
 
506 aa  302  8e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224429  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.41 
 
 
535 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  38.91 
 
 
495 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  35.99 
 
 
513 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  35.77 
 
 
521 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1605  NADH dehydrogenase (ubiquinone), M subunit  37.7 
 
 
506 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0558  NADH-quinone oxidoreductase chain M  37.9 
 
 
506 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0760  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.29 
 
 
496 aa  301  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.29344 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  35.8 
 
 
513 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0933  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.41 
 
 
505 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  36.42 
 
 
505 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  37.19 
 
 
494 aa  300  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1619  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  41.43 
 
 
494 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0249926  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1594  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D4  41.43 
 
 
494 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  36.91 
 
 
503 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  35.64 
 
 
512 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  35.67 
 
 
502 aa  297  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1059  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.56 
 
 
502 aa  297  4e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.07 
 
 
507 aa  296  5e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  37.12 
 
 
503 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>