More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0896 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
352 aa  713    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  69.23 
 
 
346 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.65 
 
 
353 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.64 
 
 
343 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.41 
 
 
350 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.26 
 
 
350 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.65 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.91 
 
 
365 aa  299  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.57 
 
 
360 aa  299  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.84 
 
 
343 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.11 
 
 
347 aa  292  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.8 
 
 
379 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.05 
 
 
368 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.18 
 
 
353 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.7 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.7 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.88 
 
 
351 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.76 
 
 
351 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.42 
 
 
536 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
344 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 
352 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.66 
 
 
352 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.42 
 
 
356 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.96 
 
 
352 aa  156  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.27 
 
 
207 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2019  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.75 
 
 
352 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  43.14 
 
 
213 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  43.96 
 
 
204 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.19 
 
 
207 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 
492 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.36 
 
 
214 aa  145  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 
207 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  40.89 
 
 
212 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.07 
 
 
220 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.16 
 
 
226 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.37 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.68 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.51 
 
 
206 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.55 
 
 
227 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.13 
 
 
204 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.55 
 
 
218 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.34 
 
 
225 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  40.31 
 
 
217 aa  137  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3114  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.2 
 
 
226 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.57 
 
 
211 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.39 
 
 
221 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.44 
 
 
218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  42.25 
 
 
206 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.1 
 
 
221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.86 
 
 
205 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.8 
 
 
211 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  42.08 
 
 
209 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.32 
 
 
213 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.02 
 
 
208 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.24 
 
 
208 aa  133  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 
206 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 
210 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.11 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.73 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.43 
 
 
206 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1343  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.85 
 
 
221 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  hitchhiker  0.000481563 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  41.88 
 
 
484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  42.54 
 
 
484 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.88 
 
 
236 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.26 
 
 
220 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.07 
 
 
213 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.95 
 
 
207 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.66 
 
 
206 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.78 
 
 
205 aa  126  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.67 
 
 
214 aa  126  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.99 
 
 
218 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.2 
 
 
206 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
497 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.05 
 
 
207 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  37.37 
 
 
497 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
234 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.02 
 
 
231 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  41.01 
 
 
494 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  40.86 
 
 
208 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.7 
 
 
217 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1455  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.38 
 
 
222 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.05 
 
 
218 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2786  Thiamine-phosphate diphosphorylase  42.11 
 
 
213 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0534  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.54 
 
 
226 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.23 
 
 
228 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.11 
 
 
211 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  35.41 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  41.76 
 
 
217 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
208 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.76 
 
 
212 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.36 
 
 
205 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.99 
 
 
210 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.79 
 
 
208 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.36 
 
 
215 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.32 
 
 
219 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.57 
 
 
219 aa  119  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.42 
 
 
216 aa  119  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10419  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.5 
 
 
222 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553415  normal  0.826852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.17 
 
 
224 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>