79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0829 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  606  1e-172  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  1.02654e-05 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 
274 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
246 aa  73.6  4e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
249 aa  72.4  8e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  24.23 
 
 
325 aa  62.8  7e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  24.88 
 
 
292 aa  62.4  9e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  22.06 
 
 
307 aa  58.9  9e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 
291 aa  58.9  9e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  22.06 
 
 
307 aa  58.9  9e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  22.06 
 
 
307 aa  58.9  9e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  22.06 
 
 
307 aa  58.5  1e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 
307 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
287 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
299 aa  57.8  2e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  24.48 
 
 
307 aa  57  3e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  22.35 
 
 
340 aa  57  3e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
293 aa  57.4  3e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 
301 aa  57  4e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  24.74 
 
 
292 aa  56.6  4e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  21.93 
 
 
307 aa  56.2  7e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
293 aa  55.8  9e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 
313 aa  55.1  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 
309 aa  55.1  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 
291 aa  55.1  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  23.11 
 
 
299 aa  55.5  1e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 
299 aa  54.3  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  22.27 
 
 
293 aa  53.1  5e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 
597 aa  52.4  8e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
317 aa  52.4  9e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  24.25 
 
 
295 aa  52  1e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 
299 aa  52.4  1e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 
299 aa  52  1e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  25.26 
 
 
266 aa  51.2  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  23.4 
 
 
242 aa  50.8  2e-05  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  21.85 
 
 
273 aa  51.2  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  24.25 
 
 
295 aa  51.2  2e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  22.83 
 
 
299 aa  51.6  2e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  22.38 
 
 
315 aa  50.8  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.72 
 
 
298 aa  50.8  3e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 
294 aa  50.8  3e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.86 
 
 
299 aa  50.4  3e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  24.53 
 
 
317 aa  50.4  3e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  24.25 
 
 
278 aa  50.4  4e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  24.15 
 
 
295 aa  50.1  4e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 
295 aa  50.4  4e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  26.21 
 
 
312 aa  50.1  5e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  21.86 
 
 
273 aa  50.1  5e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.46635e-23 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  23.88 
 
 
444 aa  49.7  6e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
302 aa  49.3  8e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.88 
 
 
296 aa  49.3  8e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  22.82 
 
 
486 aa  49.3  8e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 
395 aa  48.9  9e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 
395 aa  48.9  9e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  23.67 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  1.47175e-08 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 
404 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  24.29 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  23.19 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  23.5 
 
 
293 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  23.44 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  24.06 
 
 
293 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 
311 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 
317 aa  45.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  21.72 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  22.05 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  26.47 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  27.08 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  22.88 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 
333 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
246 aa  43.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  22.6 
 
 
305 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>