21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0827 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0827  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  297  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.348672  unclonable  9.36825e-06 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1848  ankyrin  38.06 
 
 
495 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1849  hypothetical protein  32.84 
 
 
250 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2864  hypothetical protein  28.03 
 
 
139 aa  67.4  6e-11  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3132  hypothetical protein  28.47 
 
 
139 aa  59.3  2e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.584475  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  27.34 
 
 
137 aa  54.3  5e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  25.19 
 
 
359 aa  53.5  1e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  25.71 
 
 
137 aa  52  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  29.69 
 
 
127 aa  50.1  1e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  27.27 
 
 
134 aa  48.9  2e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  27.05 
 
 
134 aa  47.8  5e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  28.8 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  28 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  28 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  28 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2650  protein of unknown function DUF1486  29.79 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.679819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  28.12 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  21.43 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  28 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  24.03 
 
 
128 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  25.86 
 
 
287 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>