125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0826 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  100 
 
 
502 aa  1040  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  1.40216e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  33.93 
 
 
544 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  34.05 
 
 
541 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  34.43 
 
 
538 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  32.17 
 
 
513 aa  244  2e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  30.63 
 
 
530 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  31.91 
 
 
543 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  30.64 
 
 
547 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  31.33 
 
 
534 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  31.66 
 
 
534 aa  222  1e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  29.38 
 
 
546 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  31.91 
 
 
543 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  31.67 
 
 
533 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  30.52 
 
 
543 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.09 
 
 
543 aa  134  4e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
547 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.84 
 
 
543 aa  128  2e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  26.36 
 
 
632 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  26.36 
 
 
632 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  26.7 
 
 
696 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  26.36 
 
 
552 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  26.36 
 
 
632 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
540 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  26.36 
 
 
632 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  26.36 
 
 
632 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  26.36 
 
 
653 aa  123  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3364  hypothetical protein  26.93 
 
 
738 aa  122  2e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.96 
 
 
572 aa  115  2e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  27.51 
 
 
533 aa  112  1e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.07 
 
 
556 aa  94  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.62 
 
 
583 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.61 
 
 
786 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
578 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 
657 aa  90.5  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28 
 
 
623 aa  90.1  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
578 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.53 
 
 
569 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
587 aa  86.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.68 
 
 
593 aa  86.3  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
563 aa  85.5  2e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
591 aa  84.3  4e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.4 
 
 
582 aa  84.7  4e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
591 aa  84.3  4e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
591 aa  84.7  4e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  25.68 
 
 
578 aa  83.2  1e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
581 aa  81.6  3e-14  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 
889 aa  80.9  5e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 
564 aa  80.1  8e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.49 
 
 
518 aa  76.3  1e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.93 
 
 
537 aa  74.7  3e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.43 
 
 
586 aa  72.8  1e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07591  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  24.23 
 
 
549 aa  71.2  4e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  26.89 
 
 
622 aa  71.2  4e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.28 
 
 
1132 aa  70.5  7e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07121  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  23.48 
 
 
547 aa  68.6  3e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.569172  normal  0.139328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.31 
 
 
557 aa  67.8  4e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07141  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  24.39 
 
 
546 aa  66.6  1e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.915082  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0088  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  23.32 
 
 
547 aa  66.6  1e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.95 
 
 
526 aa  64.3  4e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  23.01 
 
 
1150 aa  64.3  4e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.69 
 
 
565 aa  64.3  6e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.24 
 
 
569 aa  62.8  1e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  25.36 
 
 
551 aa  62.4  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.04 
 
 
535 aa  61.6  3e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.65 
 
 
552 aa  60.8  6e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.64 
 
 
1150 aa  59.7  1e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  4.90282e-05  unclonable  7.21023e-05 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.17 
 
 
582 aa  59.3  1e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.18 
 
 
579 aa  59.7  1e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  21.31 
 
 
561 aa  58.2  3e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  47.83 
 
 
554 aa  58.5  3e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.78 
 
 
1152 aa  58.2  4e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.74 
 
 
561 aa  57.8  4e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.88 
 
 
561 aa  57.4  6e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  23.45 
 
 
1152 aa  56.2  1e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.11 
 
 
567 aa  55.5  2e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1891  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.22 
 
 
570 aa  54.3  5e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  46.88 
 
 
563 aa  54.3  5e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 
489 aa  54.3  5e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06751  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  25.23 
 
 
546 aa  52.8  1e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  41.43 
 
 
521 aa  53.1  1e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  22.45 
 
 
565 aa  53.1  1e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.99 
 
 
562 aa  52.4  2e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0648  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  24.7 
 
 
546 aa  52.8  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07041  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  25.08 
 
 
546 aa  52  2e-05  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.53 
 
 
550 aa  51.2  4e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.7 
 
 
501 aa  51.2  4e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  23.01 
 
 
549 aa  50.4  8e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 
577 aa  50.1  8e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.17221e-05  hitchhiker  8.05295e-05 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  24.2 
 
 
558 aa  50.4  8e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  1.46847e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.01 
 
 
527 aa  50.1  9e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.1 
 
 
534 aa  50.1  9e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
567 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07230  cellobiose dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_2G17620)  30.14 
 
 
780 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267409  normal  0.372324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.32 
 
 
573 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.58 
 
 
470 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07267  conserved hypothetical protein  34.11 
 
 
549 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.534506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.54 
 
 
550 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.75 
 
 
512 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.79 
 
 
546 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.65 
 
 
570 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>