194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0821 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  674    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  33.54 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  31.66 
 
 
315 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  31.66 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  31.03 
 
 
317 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  30.63 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  30.63 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  31.13 
 
 
300 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  30.94 
 
 
315 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  28.61 
 
 
364 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  28.53 
 
 
316 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  36.25 
 
 
284 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  32.11 
 
 
309 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  30.89 
 
 
298 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  29.13 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  28.16 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 
318 aa  95.9  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  28.8 
 
 
290 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  31.42 
 
 
334 aa  93.2  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  25.3 
 
 
273 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  25.3 
 
 
273 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  29.07 
 
 
300 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  31.93 
 
 
226 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  26.54 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 
311 aa  85.9  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  28.43 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  28.99 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  28.38 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  28.48 
 
 
315 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  29.73 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  29.34 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  25.5 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  27.22 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  25.41 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  29.34 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  25.16 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.7 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  30 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  26.45 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4954  NmrA-like  28.66 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3206  NmrA family protein  28.66 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  30 
 
 
293 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08954  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
480 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50525  predicted protein  26.17 
 
 
688 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  27.85 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.27 
 
 
287 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  29.72 
 
 
287 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  25.47 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  26.49 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30.57 
 
 
287 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30.57 
 
 
287 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.57 
 
 
287 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  25.19 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  27.84 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6424  NmrA family protein  28.16 
 
 
288 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421273  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  27.35 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.85 
 
 
330 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  24.91 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0444  hypothetical protein  25.3 
 
 
281 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0456  hypothetical protein  25.3 
 
 
281 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.425134  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  26.1 
 
 
282 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.09 
 
 
328 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 
530 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  36.84 
 
 
506 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.65 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  27.49 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  31.25 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  22.61 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  31.3 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  31.68 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  30.63 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  31.25 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  42.31 
 
 
271 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.57 
 
 
289 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  39.02 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.54 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  40.38 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.36 
 
 
281 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06780  expressed protein  21.39 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.65729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  25.19 
 
 
276 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  26.53 
 
 
605 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  36.27 
 
 
295 aa  49.7  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  27.83 
 
 
287 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10440  NADH-ubiquinone oxidoreductase 39 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12790)  28.3 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00432444  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.96 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.88 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.07 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  29.44 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.58 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3363  hypothetical protein  26.69 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0680554  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  30.34 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  26.29 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.17 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>