More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0820 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  100 
 
 
589 aa  1219  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  1.31955e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  54.12 
 
 
568 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  48.48 
 
 
542 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.65 
 
 
566 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  29.63 
 
 
554 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.33 
 
 
559 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.69 
 
 
561 aa  232  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  31.08 
 
 
545 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1930  thiamine pyrophosphate protein central region  28.45 
 
 
563 aa  227  5e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1906  thiamine pyrophosphate protein central region  28.62 
 
 
564 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.68 
 
 
562 aa  210  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.83 
 
 
562 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  28.74 
 
 
622 aa  208  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.71 
 
 
562 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.35 
 
 
562 aa  205  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.54 
 
 
636 aa  203  8e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  28.44 
 
 
540 aa  202  1e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.45 
 
 
581 aa  199  8e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  27.21 
 
 
551 aa  200  8e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.52 
 
 
572 aa  198  2e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  29.51 
 
 
553 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.21 
 
 
572 aa  197  5e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.92 
 
 
581 aa  196  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.92 
 
 
572 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  26.39 
 
 
552 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.8 
 
 
572 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.8 
 
 
572 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.85 
 
 
578 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.20393e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.29 
 
 
565 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28 
 
 
572 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.95 
 
 
559 aa  194  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  28.55 
 
 
540 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.8 
 
 
572 aa  194  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  28.02 
 
 
536 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  26.37 
 
 
566 aa  193  9e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  28.83 
 
 
529 aa  191  3e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.51 
 
 
564 aa  191  3e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  2.43733e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27 
 
 
566 aa  191  3e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.32944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.83 
 
 
572 aa  191  3e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  2.55584e-05 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  28.6 
 
 
587 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.83 
 
 
572 aa  190  6e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.05 
 
 
557 aa  190  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  28.25 
 
 
587 aa  190  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.56 
 
 
566 aa  189  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.66 
 
 
563 aa  189  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  28.04 
 
 
587 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.83 
 
 
572 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  28.98 
 
 
542 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  28.45 
 
 
599 aa  187  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  28.6 
 
 
587 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.96 
 
 
551 aa  186  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.47 
 
 
596 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1282  acetolactate synthase catalytic subunit  28.19 
 
 
566 aa  186  1e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.7 
 
 
567 aa  186  1e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1281  acetolactate synthase catalytic subunit  28.19 
 
 
569 aa  186  1e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1488  acetolactate synthase catalytic subunit  28.19 
 
 
569 aa  186  1e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.83 
 
 
565 aa  185  2e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1556  acetolactate synthase catalytic subunit  28.19 
 
 
566 aa  185  2e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  25.96 
 
 
623 aa  185  2e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.38 
 
 
658 aa  185  2e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.66 
 
 
552 aa  184  4e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1417  acetolactate synthase catalytic subunit  28.01 
 
 
566 aa  184  4e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.24 
 
 
588 aa  184  4e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1308  acetolactate synthase catalytic subunit  28.01 
 
 
578 aa  184  4e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.61 
 
 
499 aa  184  4e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.32472e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0422  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.34 
 
 
555 aa  183  8e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.84 
 
 
569 aa  183  9e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.53 
 
 
562 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  26.11 
 
 
569 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1517  acetolactate synthase catalytic subunit  27.66 
 
 
566 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.99 
 
 
566 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.46 
 
 
557 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.89 
 
 
562 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.34 
 
 
576 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  28.42 
 
 
529 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1450  acetolactate synthase catalytic subunit  27.66 
 
 
566 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1319  acetolactate synthase catalytic subunit  27.66 
 
 
566 aa  181  3e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.71 
 
 
554 aa  181  3e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  27.78 
 
 
535 aa  181  3e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.26 
 
 
573 aa  181  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  26.21 
 
 
518 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.98 
 
 
558 aa  181  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.94 
 
 
557 aa  181  5e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  27.6 
 
 
535 aa  181  5e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  27.21 
 
 
535 aa  180  5e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.1 
 
 
557 aa  181  5e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  26.9 
 
 
548 aa  180  6e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  27.37 
 
 
542 aa  180  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  7.44784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3894  acetolactate synthase catalytic subunit  27.66 
 
 
566 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.09 
 
 
548 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  26.48 
 
 
529 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.98 
 
 
588 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.94 
 
 
572 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.56 
 
 
582 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.29619e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.94 
 
 
573 aa  178  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  25.8 
 
 
611 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  27.75 
 
 
562 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.75 
 
 
554 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.83 
 
 
536 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  26.26 
 
 
573 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>