More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0690 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  100 
 
 		 338 aa  682    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  84.91 
 
 		 337 aa  531  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  73.62 
 
 		 342 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  60.62 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  56.84 
 
 		 335 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  56.08 
 
 		 335 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  47.06 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  53.54 
 
 		 407 aa  352  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  47.35 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  47.96 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  47.35 
 
 		 333 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  51.26 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  51.86 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  50.76 
 
 		 335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  52.19 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  53.25 
 
 		 333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  50 
 
 		 330 aa  328  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  50 
 
 		 330 aa  328  8e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  51.06 
 
 		 337 aa  325  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  50.15 
 
 		 331 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  49.22 
 
 		 330 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  49.55 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  49.55 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  48.29 
 
 		 330 aa  322  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  49.09 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  49.23 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  49.24 
 
 		 332 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  51.7 
 
 		 333 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  50.46 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  48.45 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  47.83 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  50.45 
 
 		 337 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  50.94 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  50.15 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  50.77 
 
 		 333 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  48.28 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  49.85 
 
 		 333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  47.53 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  48.46 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  48.31 
 
 		 333 aa  291  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  46.79 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  47.22 
 
 		 331 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  47.98 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  47.66 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  42.14 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  47.76 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  41.41 
 
 		 331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  45.08 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  46.27 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  39.44 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  39.23 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  39.23 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  37.42 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  39.87 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  36.28 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  36.22 
 
 		 331 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  36.83 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  33.86 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  36.51 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  32.71 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  32.4 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  32.93 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  35.99 
 
 		 360 aa  163  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  32.28 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.12 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.83 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  25.8 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.62 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.3 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  27.33 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.47 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.86 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.84 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.52 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.89 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  25.79 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  31.6 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  28.62 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  24.4 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.6 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.6 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.3 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.3 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.3 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.3 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  26.14 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  25 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  27.65 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.42 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  25.56 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  26.22 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  27.19 
 
 		 642 aa  77  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  28.79 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  26.8 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2439  inosine-guanosine kinase  27.24 
 
 		 434 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0642312  normal  0.907957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>